Protein–RNA interactions for Protein: Q02505

MUC3A, Mucin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 3,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3AQ02505 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MUC3AQ02505 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MUC3AQ02505 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MUC3AQ02505 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MUC3AQ02505 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
MUC3AQ02505 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MUC3AQ02505 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MUC3AQ02505 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MUC3AQ02505 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MUC3AQ02505 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MUC3AQ02505 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MUC3AQ02505 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MUC3AQ02505 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
MUC3AQ02505 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MUC3AQ02505 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MUC3AQ02505 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MUC3AQ02505 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MUC3AQ02505 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MUC3AQ02505 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MUC3AQ02505 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MUC3AQ02505 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MUC3AQ02505 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MUC3AQ02505 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MUC3AQ02505 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MUC3AQ02505 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MUC3AQ02505 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MUC3AQ02505 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MUC3AQ02505 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MUC3AQ02505 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
MUC3AQ02505 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MUC3AQ02505 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MUC3AQ02505 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MUC3AQ02505 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MUC3AQ02505 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MUC3AQ02505 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MUC3AQ02505 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MUC3AQ02505 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MUC3AQ02505 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MUC3AQ02505 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MUC3AQ02505 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MUC3AQ02505 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MUC3AQ02505 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MUC3AQ02505 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MUC3AQ02505 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MUC3AQ02505 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MUC3AQ02505 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MUC3AQ02505 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MUC3AQ02505 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MUC3AQ02505 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MUC3AQ02505 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MUC3AQ02505 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MUC3AQ02505 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MUC3AQ02505 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MUC3AQ02505 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MUC3AQ02505 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MUC3AQ02505 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MUC3AQ02505 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MUC3AQ02505 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MUC3AQ02505 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MUC3AQ02505 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MUC3AQ02505 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MUC3AQ02505 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MUC3AQ02505 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MUC3AQ02505 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MUC3AQ02505 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MUC3AQ02505 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MUC3AQ02505 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MUC3AQ02505 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MUC3AQ02505 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MUC3AQ02505 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MUC3AQ02505 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MUC3AQ02505 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MUC3AQ02505 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MUC3AQ02505 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MUC3AQ02505 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MUC3AQ02505 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MUC3AQ02505 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MUC3AQ02505 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MUC3AQ02505 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MUC3AQ02505 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MUC3AQ02505 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MUC3AQ02505 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MUC3AQ02505 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
MUC3AQ02505 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MUC3AQ02505 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MUC3AQ02505 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MUC3AQ02505 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MUC3AQ02505 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MUC3AQ02505 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MUC3AQ02505 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
MUC3AQ02505 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MUC3AQ02505 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MUC3AQ02505 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MUC3AQ02505 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MUC3AQ02505 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MUC3AQ02505 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MUC3AQ02505 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MUC3AQ02505 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MUC3AQ02505 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MUC3AQ02505 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms