Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
CLTCQ00610 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
CLTCQ00610 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
CLTCQ00610 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
CLTCQ00610 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC39.51■■■■□ 3.91
CLTCQ00610 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
CLTCQ00610 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.5■■■■□ 3.91
CLTCQ00610 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
CLTCQ00610 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
CLTCQ00610 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.45■■■■□ 3.91
CLTCQ00610 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
CLTCQ00610 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
CLTCQ00610 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
CLTCQ00610 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
CLTCQ00610 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
CLTCQ00610 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
CLTCQ00610 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
CLTCQ00610 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
CLTCQ00610 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
CLTCQ00610 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
CLTCQ00610 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
CLTCQ00610 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
CLTCQ00610 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
CLTCQ00610 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
CLTCQ00610 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
CLTCQ00610 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC39.38■■■■□ 3.9
CLTCQ00610 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.9
CLTCQ00610 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
CLTCQ00610 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
CLTCQ00610 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
CLTCQ00610 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
CLTCQ00610 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
CLTCQ00610 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
CLTCQ00610 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CLTCQ00610 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CLTCQ00610 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
CLTCQ00610 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
CLTCQ00610 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC39.33■■■■□ 3.89
CLTCQ00610 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
CLTCQ00610 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CLTCQ00610 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CLTCQ00610 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CLTCQ00610 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC39.28■■■■□ 3.88
CLTCQ00610 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
CLTCQ00610 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
CLTCQ00610 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
CLTCQ00610 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
CLTCQ00610 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CLTCQ00610 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CLTCQ00610 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
CLTCQ00610 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CLTCQ00610 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
CLTCQ00610 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
CLTCQ00610 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
CLTCQ00610 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC39.19■■■■□ 3.86
CLTCQ00610 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
CLTCQ00610 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
CLTCQ00610 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
CLTCQ00610 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
CLTCQ00610 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
CLTCQ00610 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CLTCQ00610 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
CLTCQ00610 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CLTCQ00610 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
CLTCQ00610 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
CLTCQ00610 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
CLTCQ00610 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
CLTCQ00610 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
CLTCQ00610 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
CLTCQ00610 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
CLTCQ00610 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
CLTCQ00610 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
CLTCQ00610 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
CLTCQ00610 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
CLTCQ00610 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC39.1■■■■□ 3.85
CLTCQ00610 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
CLTCQ00610 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC39.09■■■■□ 3.85
CLTCQ00610 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
CLTCQ00610 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
CLTCQ00610 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CLTCQ00610 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CLTCQ00610 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
CLTCQ00610 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC39■■■■□ 3.83
CLTCQ00610 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC39■■■■□ 3.83
CLTCQ00610 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC39■■■■□ 3.83
CLTCQ00610 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
CLTCQ00610 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
CLTCQ00610 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
CLTCQ00610 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
CLTCQ00610 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
CLTCQ00610 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
CLTCQ00610 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
CLTCQ00610 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CLTCQ00610 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CLTCQ00610 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC38.93■■■■□ 3.82
CLTCQ00610 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
CLTCQ00610 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
CLTCQ00610 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
CLTCQ00610 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
CLTCQ00610 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms