Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDC42EP1Q00587 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDC42EP1Q00587 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDC42EP1Q00587 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDC42EP1Q00587 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDC42EP1Q00587 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDC42EP1Q00587 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDC42EP1Q00587 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDC42EP1Q00587 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CDC42EP1Q00587 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CDC42EP1Q00587 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CDC42EP1Q00587 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDC42EP1Q00587 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDC42EP1Q00587 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDC42EP1Q00587 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDC42EP1Q00587 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDC42EP1Q00587 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDC42EP1Q00587 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDC42EP1Q00587 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDC42EP1Q00587 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDC42EP1Q00587 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDC42EP1Q00587 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CDC42EP1Q00587 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CDC42EP1Q00587 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDC42EP1Q00587 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDC42EP1Q00587 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CDC42EP1Q00587 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDC42EP1Q00587 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDC42EP1Q00587 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDC42EP1Q00587 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDC42EP1Q00587 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDC42EP1Q00587 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDC42EP1Q00587 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDC42EP1Q00587 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDC42EP1Q00587 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDC42EP1Q00587 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDC42EP1Q00587 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CDC42EP1Q00587 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CDC42EP1Q00587 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CDC42EP1Q00587 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDC42EP1Q00587 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDC42EP1Q00587 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDC42EP1Q00587 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDC42EP1Q00587 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDC42EP1Q00587 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDC42EP1Q00587 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDC42EP1Q00587 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDC42EP1Q00587 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDC42EP1Q00587 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDC42EP1Q00587 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDC42EP1Q00587 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDC42EP1Q00587 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDC42EP1Q00587 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDC42EP1Q00587 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CDC42EP1Q00587 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDC42EP1Q00587 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CDC42EP1Q00587 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
CDC42EP1Q00587 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDC42EP1Q00587 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDC42EP1Q00587 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDC42EP1Q00587 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDC42EP1Q00587 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDC42EP1Q00587 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CDC42EP1Q00587 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDC42EP1Q00587 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDC42EP1Q00587 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDC42EP1Q00587 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDC42EP1Q00587 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDC42EP1Q00587 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDC42EP1Q00587 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDC42EP1Q00587 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDC42EP1Q00587 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDC42EP1Q00587 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDC42EP1Q00587 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDC42EP1Q00587 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CDC42EP1Q00587 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDC42EP1Q00587 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDC42EP1Q00587 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CDC42EP1Q00587 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDC42EP1Q00587 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CDC42EP1Q00587 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CDC42EP1Q00587 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CDC42EP1Q00587 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CDC42EP1Q00587 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CDC42EP1Q00587 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CDC42EP1Q00587 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CDC42EP1Q00587 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CDC42EP1Q00587 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CDC42EP1Q00587 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDC42EP1Q00587 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CDC42EP1Q00587 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDC42EP1Q00587 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDC42EP1Q00587 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDC42EP1Q00587 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDC42EP1Q00587 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDC42EP1Q00587 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CDC42EP1Q00587 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDC42EP1Q00587 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDC42EP1Q00587 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDC42EP1Q00587 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms