Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MAT1AQ00266 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAT1AQ00266 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAT1AQ00266 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAT1AQ00266 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAT1AQ00266 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAT1AQ00266 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAT1AQ00266 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAT1AQ00266 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MAT1AQ00266 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MAT1AQ00266 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MAT1AQ00266 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MAT1AQ00266 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MAT1AQ00266 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MAT1AQ00266 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MAT1AQ00266 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MAT1AQ00266 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MAT1AQ00266 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MAT1AQ00266 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MAT1AQ00266 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MAT1AQ00266 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MAT1AQ00266 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MAT1AQ00266 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MAT1AQ00266 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MAT1AQ00266 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MAT1AQ00266 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MAT1AQ00266 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MAT1AQ00266 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MAT1AQ00266 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MAT1AQ00266 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAT1AQ00266 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAT1AQ00266 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAT1AQ00266 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAT1AQ00266 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MAT1AQ00266 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAT1AQ00266 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAT1AQ00266 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAT1AQ00266 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAT1AQ00266 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAT1AQ00266 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAT1AQ00266 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MAT1AQ00266 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MAT1AQ00266 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAT1AQ00266 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAT1AQ00266 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAT1AQ00266 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAT1AQ00266 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAT1AQ00266 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAT1AQ00266 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAT1AQ00266 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAT1AQ00266 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAT1AQ00266 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAT1AQ00266 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAT1AQ00266 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAT1AQ00266 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAT1AQ00266 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAT1AQ00266 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAT1AQ00266 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAT1AQ00266 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAT1AQ00266 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAT1AQ00266 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAT1AQ00266 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAT1AQ00266 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MAT1AQ00266 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MAT1AQ00266 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAT1AQ00266 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAT1AQ00266 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MAT1AQ00266 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAT1AQ00266 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAT1AQ00266 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAT1AQ00266 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAT1AQ00266 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAT1AQ00266 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAT1AQ00266 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MAT1AQ00266 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAT1AQ00266 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAT1AQ00266 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAT1AQ00266 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAT1AQ00266 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MAT1AQ00266 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAT1AQ00266 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAT1AQ00266 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAT1AQ00266 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MAT1AQ00266 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MAT1AQ00266 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MAT1AQ00266 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MAT1AQ00266 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MAT1AQ00266 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAT1AQ00266 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAT1AQ00266 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAT1AQ00266 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAT1AQ00266 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MAT1AQ00266 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MAT1AQ00266 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MAT1AQ00266 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MAT1AQ00266 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MAT1AQ00266 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MAT1AQ00266 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAT1AQ00266 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAT1AQ00266 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms