Protein–RNA interactions for Protein: P86478

PRR20E, Proline-rich protein 20E, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR20EP86478 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRR20EP86478 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRR20EP86478 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRR20EP86478 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRR20EP86478 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRR20EP86478 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRR20EP86478 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRR20EP86478 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRR20EP86478 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRR20EP86478 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRR20EP86478 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRR20EP86478 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRR20EP86478 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRR20EP86478 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRR20EP86478 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRR20EP86478 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRR20EP86478 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRR20EP86478 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRR20EP86478 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRR20EP86478 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRR20EP86478 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PRR20EP86478 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRR20EP86478 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRR20EP86478 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PRR20EP86478 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRR20EP86478 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRR20EP86478 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRR20EP86478 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRR20EP86478 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRR20EP86478 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRR20EP86478 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRR20EP86478 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRR20EP86478 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRR20EP86478 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRR20EP86478 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRR20EP86478 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRR20EP86478 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRR20EP86478 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRR20EP86478 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRR20EP86478 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRR20EP86478 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRR20EP86478 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRR20EP86478 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRR20EP86478 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRR20EP86478 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRR20EP86478 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRR20EP86478 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRR20EP86478 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRR20EP86478 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRR20EP86478 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRR20EP86478 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRR20EP86478 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRR20EP86478 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRR20EP86478 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRR20EP86478 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRR20EP86478 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRR20EP86478 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRR20EP86478 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRR20EP86478 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRR20EP86478 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRR20EP86478 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRR20EP86478 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRR20EP86478 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PRR20EP86478 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRR20EP86478 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRR20EP86478 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRR20EP86478 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRR20EP86478 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRR20EP86478 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRR20EP86478 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRR20EP86478 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRR20EP86478 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRR20EP86478 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRR20EP86478 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRR20EP86478 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRR20EP86478 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRR20EP86478 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRR20EP86478 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRR20EP86478 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRR20EP86478 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRR20EP86478 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRR20EP86478 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRR20EP86478 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRR20EP86478 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRR20EP86478 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRR20EP86478 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRR20EP86478 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRR20EP86478 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRR20EP86478 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRR20EP86478 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PRR20EP86478 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRR20EP86478 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRR20EP86478 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRR20EP86478 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRR20EP86478 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRR20EP86478 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRR20EP86478 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRR20EP86478 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRR20EP86478 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRR20EP86478 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms