Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPCAP84074 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HPCAP84074 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPCAP84074 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPCAP84074 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HPCAP84074 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HPCAP84074 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HPCAP84074 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HPCAP84074 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HPCAP84074 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HPCAP84074 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HPCAP84074 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HPCAP84074 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HPCAP84074 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPCAP84074 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPCAP84074 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HPCAP84074 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HPCAP84074 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HPCAP84074 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HPCAP84074 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPCAP84074 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPCAP84074 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPCAP84074 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPCAP84074 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPCAP84074 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPCAP84074 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPCAP84074 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPCAP84074 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
HPCAP84074 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HPCAP84074 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HPCAP84074 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HPCAP84074 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HPCAP84074 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HPCAP84074 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HPCAP84074 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPCAP84074 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPCAP84074 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPCAP84074 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPCAP84074 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPCAP84074 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPCAP84074 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPCAP84074 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPCAP84074 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPCAP84074 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPCAP84074 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HPCAP84074 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HPCAP84074 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HPCAP84074 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HPCAP84074 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HPCAP84074 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HPCAP84074 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HPCAP84074 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HPCAP84074 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HPCAP84074 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPCAP84074 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPCAP84074 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPCAP84074 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPCAP84074 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPCAP84074 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HPCAP84074 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HPCAP84074 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HPCAP84074 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPCAP84074 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPCAP84074 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPCAP84074 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPCAP84074 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPCAP84074 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPCAP84074 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPCAP84074 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPCAP84074 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPCAP84074 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPCAP84074 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPCAP84074 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPCAP84074 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HPCAP84074 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HPCAP84074 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPCAP84074 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPCAP84074 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPCAP84074 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPCAP84074 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPCAP84074 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HPCAP84074 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPCAP84074 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPCAP84074 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPCAP84074 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPCAP84074 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPCAP84074 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPCAP84074 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPCAP84074 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPCAP84074 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPCAP84074 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPCAP84074 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPCAP84074 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPCAP84074 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPCAP84074 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPCAP84074 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPCAP84074 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HPCAP84074 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPCAP84074 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HPCAP84074 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms