Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFI35P80217 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
IFI35P80217 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IFI35P80217 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IFI35P80217 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IFI35P80217 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IFI35P80217 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFI35P80217 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFI35P80217 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFI35P80217 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFI35P80217 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFI35P80217 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFI35P80217 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFI35P80217 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFI35P80217 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFI35P80217 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFI35P80217 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFI35P80217 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFI35P80217 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFI35P80217 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFI35P80217 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
IFI35P80217 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFI35P80217 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFI35P80217 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
IFI35P80217 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFI35P80217 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFI35P80217 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFI35P80217 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFI35P80217 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFI35P80217 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFI35P80217 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFI35P80217 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
IFI35P80217 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFI35P80217 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFI35P80217 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFI35P80217 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFI35P80217 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFI35P80217 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFI35P80217 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFI35P80217 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFI35P80217 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFI35P80217 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFI35P80217 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFI35P80217 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFI35P80217 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFI35P80217 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFI35P80217 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFI35P80217 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFI35P80217 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFI35P80217 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFI35P80217 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFI35P80217 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFI35P80217 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFI35P80217 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFI35P80217 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFI35P80217 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFI35P80217 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFI35P80217 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IFI35P80217 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
IFI35P80217 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
IFI35P80217 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFI35P80217 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFI35P80217 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
IFI35P80217 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFI35P80217 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFI35P80217 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFI35P80217 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
IFI35P80217 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFI35P80217 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFI35P80217 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFI35P80217 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFI35P80217 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
IFI35P80217 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
IFI35P80217 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IFI35P80217 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IFI35P80217 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IFI35P80217 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFI35P80217 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFI35P80217 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFI35P80217 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFI35P80217 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFI35P80217 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
IFI35P80217 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
IFI35P80217 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IFI35P80217 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IFI35P80217 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFI35P80217 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFI35P80217 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFI35P80217 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFI35P80217 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFI35P80217 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFI35P80217 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFI35P80217 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFI35P80217 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFI35P80217 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFI35P80217 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFI35P80217 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFI35P80217 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFI35P80217 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFI35P80217 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms