Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHOBP62745 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHOBP62745 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHOBP62745 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHOBP62745 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHOBP62745 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHOBP62745 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHOBP62745 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHOBP62745 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHOBP62745 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHOBP62745 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHOBP62745 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHOBP62745 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHOBP62745 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHOBP62745 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RHOBP62745 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHOBP62745 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHOBP62745 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHOBP62745 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHOBP62745 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHOBP62745 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHOBP62745 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHOBP62745 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RHOBP62745 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOBP62745 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOBP62745 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOBP62745 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOBP62745 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOBP62745 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOBP62745 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOBP62745 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOBP62745 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOBP62745 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOBP62745 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOBP62745 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOBP62745 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOBP62745 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOBP62745 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOBP62745 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOBP62745 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOBP62745 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOBP62745 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOBP62745 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOBP62745 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOBP62745 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOBP62745 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOBP62745 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOBP62745 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOBP62745 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOBP62745 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOBP62745 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOBP62745 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOBP62745 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOBP62745 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOBP62745 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOBP62745 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOBP62745 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOBP62745 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOBP62745 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOBP62745 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOBP62745 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOBP62745 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOBP62745 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOBP62745 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOBP62745 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHOBP62745 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHOBP62745 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHOBP62745 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOBP62745 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOBP62745 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOBP62745 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOBP62745 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOBP62745 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOBP62745 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOBP62745 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOBP62745 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOBP62745 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOBP62745 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOBP62745 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOBP62745 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOBP62745 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOBP62745 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOBP62745 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOBP62745 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHOBP62745 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHOBP62745 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHOBP62745 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHOBP62745 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHOBP62745 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHOBP62745 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RHOBP62745 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RHOBP62745 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHOBP62745 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHOBP62745 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHOBP62745 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHOBP62745 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHOBP62745 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHOBP62745 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHOBP62745 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHOBP62745 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms