Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SNRPD1P62314 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNRPD1P62314 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNRPD1P62314 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNRPD1P62314 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNRPD1P62314 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SNRPD1P62314 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNRPD1P62314 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNRPD1P62314 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNRPD1P62314 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNRPD1P62314 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNRPD1P62314 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNRPD1P62314 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SNRPD1P62314 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNRPD1P62314 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNRPD1P62314 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SNRPD1P62314 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNRPD1P62314 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNRPD1P62314 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNRPD1P62314 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNRPD1P62314 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNRPD1P62314 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNRPD1P62314 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNRPD1P62314 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNRPD1P62314 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SNRPD1P62314 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNRPD1P62314 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNRPD1P62314 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNRPD1P62314 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNRPD1P62314 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNRPD1P62314 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNRPD1P62314 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNRPD1P62314 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNRPD1P62314 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNRPD1P62314 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNRPD1P62314 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SNRPD1P62314 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNRPD1P62314 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNRPD1P62314 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNRPD1P62314 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNRPD1P62314 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNRPD1P62314 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNRPD1P62314 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNRPD1P62314 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNRPD1P62314 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNRPD1P62314 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNRPD1P62314 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNRPD1P62314 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNRPD1P62314 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNRPD1P62314 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SNRPD1P62314 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNRPD1P62314 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNRPD1P62314 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNRPD1P62314 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNRPD1P62314 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNRPD1P62314 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNRPD1P62314 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNRPD1P62314 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNRPD1P62314 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNRPD1P62314 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNRPD1P62314 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNRPD1P62314 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNRPD1P62314 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNRPD1P62314 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNRPD1P62314 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNRPD1P62314 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNRPD1P62314 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNRPD1P62314 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNRPD1P62314 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNRPD1P62314 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SNRPD1P62314 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNRPD1P62314 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNRPD1P62314 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNRPD1P62314 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNRPD1P62314 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SNRPD1P62314 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNRPD1P62314 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNRPD1P62314 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNRPD1P62314 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNRPD1P62314 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNRPD1P62314 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNRPD1P62314 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNRPD1P62314 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNRPD1P62314 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNRPD1P62314 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNRPD1P62314 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNRPD1P62314 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNRPD1P62314 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNRPD1P62314 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SNRPD1P62314 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SNRPD1P62314 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNRPD1P62314 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNRPD1P62314 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNRPD1P62314 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNRPD1P62314 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SNRPD1P62314 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNRPD1P62314 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNRPD1P62314 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNRPD1P62314 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNRPD1P62314 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms