Protein–RNA interactions for Protein: P62079

TSPAN5, Tetraspanin-5, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN5P62079 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN5P62079 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN5P62079 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN5P62079 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN5P62079 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN5P62079 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN5P62079 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN5P62079 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN5P62079 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSPAN5P62079 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSPAN5P62079 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN5P62079 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN5P62079 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN5P62079 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN5P62079 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN5P62079 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN5P62079 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN5P62079 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN5P62079 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN5P62079 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN5P62079 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN5P62079 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN5P62079 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN5P62079 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN5P62079 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN5P62079 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN5P62079 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN5P62079 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN5P62079 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSPAN5P62079 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSPAN5P62079 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSPAN5P62079 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN5P62079 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN5P62079 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN5P62079 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN5P62079 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN5P62079 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN5P62079 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN5P62079 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN5P62079 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN5P62079 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN5P62079 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN5P62079 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN5P62079 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN5P62079 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN5P62079 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN5P62079 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN5P62079 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN5P62079 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN5P62079 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN5P62079 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN5P62079 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN5P62079 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN5P62079 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN5P62079 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN5P62079 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN5P62079 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN5P62079 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN5P62079 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN5P62079 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN5P62079 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN5P62079 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN5P62079 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN5P62079 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN5P62079 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN5P62079 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN5P62079 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN5P62079 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN5P62079 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN5P62079 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN5P62079 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN5P62079 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN5P62079 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN5P62079 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN5P62079 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN5P62079 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN5P62079 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN5P62079 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN5P62079 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN5P62079 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN5P62079 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN5P62079 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN5P62079 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN5P62079 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN5P62079 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN5P62079 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN5P62079 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN5P62079 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN5P62079 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN5P62079 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN5P62079 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN5P62079 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN5P62079 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN5P62079 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN5P62079 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN5P62079 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN5P62079 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN5P62079 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN5P62079 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN5P62079 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms