Protein–RNA interactions for Protein: P61160

ACTR2, Actin-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR2P61160 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ACTR2P61160 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ACTR2P61160 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ACTR2P61160 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ACTR2P61160 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ACTR2P61160 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ACTR2P61160 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ACTR2P61160 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ACTR2P61160 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
ACTR2P61160 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ACTR2P61160 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ACTR2P61160 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ACTR2P61160 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ACTR2P61160 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ACTR2P61160 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ACTR2P61160 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ACTR2P61160 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ACTR2P61160 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ACTR2P61160 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ACTR2P61160 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ACTR2P61160 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ACTR2P61160 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ACTR2P61160 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ACTR2P61160 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ACTR2P61160 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ACTR2P61160 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ACTR2P61160 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ACTR2P61160 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ACTR2P61160 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ACTR2P61160 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ACTR2P61160 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ACTR2P61160 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ACTR2P61160 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ACTR2P61160 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ACTR2P61160 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ACTR2P61160 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ACTR2P61160 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ACTR2P61160 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ACTR2P61160 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ACTR2P61160 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ACTR2P61160 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ACTR2P61160 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ACTR2P61160 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ACTR2P61160 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ACTR2P61160 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ACTR2P61160 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ACTR2P61160 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ACTR2P61160 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ACTR2P61160 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ACTR2P61160 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
ACTR2P61160 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ACTR2P61160 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ACTR2P61160 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ACTR2P61160 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ACTR2P61160 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ACTR2P61160 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ACTR2P61160 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ACTR2P61160 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ACTR2P61160 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ACTR2P61160 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ACTR2P61160 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ACTR2P61160 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ACTR2P61160 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ACTR2P61160 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ACTR2P61160 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ACTR2P61160 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ACTR2P61160 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ACTR2P61160 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ACTR2P61160 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ACTR2P61160 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ACTR2P61160 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ACTR2P61160 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ACTR2P61160 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ACTR2P61160 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ACTR2P61160 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ACTR2P61160 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ACTR2P61160 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ACTR2P61160 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ACTR2P61160 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ACTR2P61160 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ACTR2P61160 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ACTR2P61160 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ACTR2P61160 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ACTR2P61160 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
ACTR2P61160 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
ACTR2P61160 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ACTR2P61160 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ACTR2P61160 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ACTR2P61160 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ACTR2P61160 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ACTR2P61160 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ACTR2P61160 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ACTR2P61160 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ACTR2P61160 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ACTR2P61160 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ACTR2P61160 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ACTR2P61160 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ACTR2P61160 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ACTR2P61160 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ACTR2P61160 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms