Protein–RNA interactions for Protein: P56715

RP1, Oxygen-regulated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP1P56715 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RP1P56715 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RP1P56715 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RP1P56715 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RP1P56715 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RP1P56715 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RP1P56715 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RP1P56715 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RP1P56715 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RP1P56715 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RP1P56715 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RP1P56715 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RP1P56715 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RP1P56715 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RP1P56715 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RP1P56715 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RP1P56715 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RP1P56715 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RP1P56715 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RP1P56715 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RP1P56715 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RP1P56715 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RP1P56715 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RP1P56715 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RP1P56715 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RP1P56715 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RP1P56715 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RP1P56715 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RP1P56715 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RP1P56715 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RP1P56715 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RP1P56715 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RP1P56715 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RP1P56715 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RP1P56715 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RP1P56715 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RP1P56715 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RP1P56715 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RP1P56715 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RP1P56715 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RP1P56715 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RP1P56715 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RP1P56715 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RP1P56715 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RP1P56715 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RP1P56715 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RP1P56715 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RP1P56715 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RP1P56715 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RP1P56715 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RP1P56715 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RP1P56715 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RP1P56715 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RP1P56715 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RP1P56715 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RP1P56715 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RP1P56715 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RP1P56715 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RP1P56715 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RP1P56715 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RP1P56715 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RP1P56715 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RP1P56715 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RP1P56715 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RP1P56715 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RP1P56715 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RP1P56715 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RP1P56715 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RP1P56715 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RP1P56715 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RP1P56715 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RP1P56715 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RP1P56715 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RP1P56715 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RP1P56715 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RP1P56715 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RP1P56715 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RP1P56715 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RP1P56715 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RP1P56715 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RP1P56715 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RP1P56715 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RP1P56715 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RP1P56715 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RP1P56715 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RP1P56715 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RP1P56715 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RP1P56715 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RP1P56715 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RP1P56715 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RP1P56715 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RP1P56715 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RP1P56715 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RP1P56715 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RP1P56715 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RP1P56715 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RP1P56715 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RP1P56715 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RP1P56715 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RP1P56715 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms