Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH15P55291 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH15P55291 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH15P55291 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH15P55291 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH15P55291 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH15P55291 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDH15P55291 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDH15P55291 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH15P55291 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH15P55291 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH15P55291 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH15P55291 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH15P55291 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH15P55291 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH15P55291 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH15P55291 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH15P55291 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH15P55291 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH15P55291 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH15P55291 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH15P55291 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH15P55291 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH15P55291 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH15P55291 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH15P55291 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH15P55291 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH15P55291 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH15P55291 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH15P55291 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH15P55291 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH15P55291 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH15P55291 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH15P55291 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH15P55291 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH15P55291 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH15P55291 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH15P55291 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH15P55291 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH15P55291 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH15P55291 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH15P55291 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH15P55291 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH15P55291 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH15P55291 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH15P55291 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH15P55291 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH15P55291 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH15P55291 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH15P55291 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH15P55291 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH15P55291 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH15P55291 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH15P55291 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH15P55291 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH15P55291 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH15P55291 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH15P55291 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH15P55291 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH15P55291 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH15P55291 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH15P55291 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH15P55291 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH15P55291 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH15P55291 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH15P55291 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH15P55291 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH15P55291 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH15P55291 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH15P55291 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDH15P55291 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDH15P55291 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDH15P55291 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH15P55291 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH15P55291 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH15P55291 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH15P55291 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH15P55291 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH15P55291 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH15P55291 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH15P55291 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH15P55291 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH15P55291 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH15P55291 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH15P55291 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH15P55291 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH15P55291 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH15P55291 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH15P55291 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH15P55291 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH15P55291 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH15P55291 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH15P55291 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH15P55291 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH15P55291 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH15P55291 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH15P55291 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH15P55291 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH15P55291 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH15P55291 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms