Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRISP3P54108 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRISP3P54108 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRISP3P54108 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRISP3P54108 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRISP3P54108 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRISP3P54108 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRISP3P54108 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CRISP3P54108 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRISP3P54108 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRISP3P54108 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRISP3P54108 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRISP3P54108 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRISP3P54108 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRISP3P54108 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRISP3P54108 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CRISP3P54108 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRISP3P54108 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRISP3P54108 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRISP3P54108 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRISP3P54108 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRISP3P54108 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRISP3P54108 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CRISP3P54108 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRISP3P54108 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRISP3P54108 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRISP3P54108 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRISP3P54108 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRISP3P54108 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRISP3P54108 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRISP3P54108 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRISP3P54108 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRISP3P54108 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRISP3P54108 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRISP3P54108 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRISP3P54108 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRISP3P54108 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRISP3P54108 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CRISP3P54108 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRISP3P54108 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRISP3P54108 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRISP3P54108 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRISP3P54108 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRISP3P54108 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRISP3P54108 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRISP3P54108 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRISP3P54108 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRISP3P54108 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRISP3P54108 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRISP3P54108 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CRISP3P54108 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CRISP3P54108 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRISP3P54108 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRISP3P54108 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRISP3P54108 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRISP3P54108 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRISP3P54108 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRISP3P54108 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRISP3P54108 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRISP3P54108 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRISP3P54108 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CRISP3P54108 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRISP3P54108 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRISP3P54108 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRISP3P54108 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRISP3P54108 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRISP3P54108 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRISP3P54108 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRISP3P54108 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRISP3P54108 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRISP3P54108 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRISP3P54108 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRISP3P54108 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRISP3P54108 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRISP3P54108 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRISP3P54108 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRISP3P54108 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRISP3P54108 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRISP3P54108 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRISP3P54108 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRISP3P54108 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRISP3P54108 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRISP3P54108 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRISP3P54108 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRISP3P54108 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRISP3P54108 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRISP3P54108 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRISP3P54108 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRISP3P54108 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRISP3P54108 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRISP3P54108 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRISP3P54108 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CRISP3P54108 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRISP3P54108 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRISP3P54108 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRISP3P54108 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRISP3P54108 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRISP3P54108 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRISP3P54108 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRISP3P54108 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms