Protein–RNA interactions for Protein: P52306

RAP1GDS1, Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1GDS1P52306 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAP1GDS1P52306 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAP1GDS1P52306 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAP1GDS1P52306 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAP1GDS1P52306 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAP1GDS1P52306 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAP1GDS1P52306 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAP1GDS1P52306 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAP1GDS1P52306 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAP1GDS1P52306 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RAP1GDS1P52306 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAP1GDS1P52306 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAP1GDS1P52306 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAP1GDS1P52306 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAP1GDS1P52306 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAP1GDS1P52306 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAP1GDS1P52306 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAP1GDS1P52306 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAP1GDS1P52306 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAP1GDS1P52306 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAP1GDS1P52306 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAP1GDS1P52306 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAP1GDS1P52306 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAP1GDS1P52306 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAP1GDS1P52306 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAP1GDS1P52306 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAP1GDS1P52306 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAP1GDS1P52306 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAP1GDS1P52306 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAP1GDS1P52306 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAP1GDS1P52306 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAP1GDS1P52306 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAP1GDS1P52306 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAP1GDS1P52306 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAP1GDS1P52306 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAP1GDS1P52306 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAP1GDS1P52306 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAP1GDS1P52306 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAP1GDS1P52306 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAP1GDS1P52306 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAP1GDS1P52306 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAP1GDS1P52306 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAP1GDS1P52306 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAP1GDS1P52306 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAP1GDS1P52306 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAP1GDS1P52306 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAP1GDS1P52306 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RAP1GDS1P52306 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAP1GDS1P52306 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RAP1GDS1P52306 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAP1GDS1P52306 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAP1GDS1P52306 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAP1GDS1P52306 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAP1GDS1P52306 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAP1GDS1P52306 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAP1GDS1P52306 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAP1GDS1P52306 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAP1GDS1P52306 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RAP1GDS1P52306 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RAP1GDS1P52306 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAP1GDS1P52306 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAP1GDS1P52306 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAP1GDS1P52306 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAP1GDS1P52306 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAP1GDS1P52306 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAP1GDS1P52306 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAP1GDS1P52306 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAP1GDS1P52306 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAP1GDS1P52306 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAP1GDS1P52306 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAP1GDS1P52306 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAP1GDS1P52306 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAP1GDS1P52306 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAP1GDS1P52306 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAP1GDS1P52306 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAP1GDS1P52306 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAP1GDS1P52306 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAP1GDS1P52306 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAP1GDS1P52306 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAP1GDS1P52306 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAP1GDS1P52306 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAP1GDS1P52306 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAP1GDS1P52306 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAP1GDS1P52306 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAP1GDS1P52306 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAP1GDS1P52306 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAP1GDS1P52306 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAP1GDS1P52306 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAP1GDS1P52306 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAP1GDS1P52306 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAP1GDS1P52306 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RAP1GDS1P52306 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAP1GDS1P52306 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAP1GDS1P52306 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RAP1GDS1P52306 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAP1GDS1P52306 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAP1GDS1P52306 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAP1GDS1P52306 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAP1GDS1P52306 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAP1GDS1P52306 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms