Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGDP52209 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGDP52209 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGDP52209 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGDP52209 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGDP52209 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGDP52209 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGDP52209 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGDP52209 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGDP52209 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGDP52209 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PGDP52209 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGDP52209 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGDP52209 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PGDP52209 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PGDP52209 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PGDP52209 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PGDP52209 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PGDP52209 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGDP52209 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGDP52209 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGDP52209 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGDP52209 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGDP52209 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGDP52209 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PGDP52209 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGDP52209 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGDP52209 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGDP52209 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGDP52209 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PGDP52209 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGDP52209 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGDP52209 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGDP52209 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGDP52209 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGDP52209 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGDP52209 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGDP52209 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGDP52209 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PGDP52209 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGDP52209 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGDP52209 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGDP52209 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGDP52209 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGDP52209 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGDP52209 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGDP52209 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGDP52209 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGDP52209 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGDP52209 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGDP52209 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGDP52209 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGDP52209 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGDP52209 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGDP52209 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGDP52209 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGDP52209 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGDP52209 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGDP52209 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PGDP52209 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGDP52209 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGDP52209 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGDP52209 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGDP52209 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGDP52209 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGDP52209 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGDP52209 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGDP52209 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PGDP52209 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGDP52209 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PGDP52209 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PGDP52209 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PGDP52209 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PGDP52209 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PGDP52209 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PGDP52209 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGDP52209 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGDP52209 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGDP52209 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGDP52209 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGDP52209 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGDP52209 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGDP52209 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGDP52209 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGDP52209 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGDP52209 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGDP52209 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PGDP52209 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGDP52209 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGDP52209 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGDP52209 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PGDP52209 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PGDP52209 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PGDP52209 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PGDP52209 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGDP52209 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PGDP52209 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PGDP52209 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGDP52209 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGDP52209 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms