Protein–RNA interactions for Protein: P49761

CLK3, Dual specificity protein kinase CLK3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK3P49761 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLK3P49761 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLK3P49761 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLK3P49761 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLK3P49761 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLK3P49761 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLK3P49761 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLK3P49761 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLK3P49761 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLK3P49761 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLK3P49761 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLK3P49761 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLK3P49761 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLK3P49761 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLK3P49761 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLK3P49761 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLK3P49761 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLK3P49761 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLK3P49761 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CLK3P49761 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLK3P49761 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLK3P49761 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLK3P49761 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLK3P49761 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLK3P49761 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLK3P49761 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLK3P49761 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLK3P49761 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLK3P49761 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLK3P49761 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLK3P49761 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLK3P49761 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLK3P49761 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLK3P49761 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLK3P49761 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLK3P49761 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLK3P49761 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLK3P49761 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLK3P49761 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLK3P49761 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLK3P49761 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLK3P49761 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLK3P49761 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLK3P49761 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLK3P49761 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLK3P49761 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLK3P49761 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLK3P49761 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLK3P49761 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLK3P49761 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLK3P49761 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLK3P49761 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLK3P49761 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLK3P49761 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLK3P49761 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLK3P49761 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLK3P49761 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLK3P49761 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLK3P49761 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLK3P49761 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLK3P49761 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CLK3P49761 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLK3P49761 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLK3P49761 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLK3P49761 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLK3P49761 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLK3P49761 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLK3P49761 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLK3P49761 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLK3P49761 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLK3P49761 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CLK3P49761 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLK3P49761 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLK3P49761 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLK3P49761 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLK3P49761 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CLK3P49761 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLK3P49761 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLK3P49761 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLK3P49761 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLK3P49761 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLK3P49761 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLK3P49761 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLK3P49761 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLK3P49761 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLK3P49761 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLK3P49761 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLK3P49761 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CLK3P49761 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLK3P49761 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLK3P49761 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLK3P49761 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLK3P49761 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLK3P49761 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLK3P49761 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLK3P49761 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLK3P49761 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLK3P49761 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CLK3P49761 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CLK3P49761 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.9 ms