Protein–RNA interactions for Protein: P49590

HARS2, Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARS2P49590 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HARS2P49590 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HARS2P49590 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HARS2P49590 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HARS2P49590 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HARS2P49590 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HARS2P49590 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HARS2P49590 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HARS2P49590 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HARS2P49590 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HARS2P49590 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HARS2P49590 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HARS2P49590 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
HARS2P49590 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HARS2P49590 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HARS2P49590 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HARS2P49590 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HARS2P49590 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HARS2P49590 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HARS2P49590 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HARS2P49590 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HARS2P49590 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HARS2P49590 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HARS2P49590 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HARS2P49590 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HARS2P49590 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HARS2P49590 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HARS2P49590 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HARS2P49590 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HARS2P49590 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HARS2P49590 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HARS2P49590 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HARS2P49590 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HARS2P49590 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HARS2P49590 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HARS2P49590 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HARS2P49590 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HARS2P49590 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HARS2P49590 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HARS2P49590 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HARS2P49590 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HARS2P49590 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HARS2P49590 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
HARS2P49590 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HARS2P49590 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
HARS2P49590 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HARS2P49590 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HARS2P49590 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HARS2P49590 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HARS2P49590 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HARS2P49590 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HARS2P49590 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HARS2P49590 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HARS2P49590 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HARS2P49590 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HARS2P49590 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HARS2P49590 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HARS2P49590 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HARS2P49590 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HARS2P49590 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HARS2P49590 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HARS2P49590 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HARS2P49590 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HARS2P49590 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HARS2P49590 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HARS2P49590 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HARS2P49590 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HARS2P49590 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HARS2P49590 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HARS2P49590 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HARS2P49590 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HARS2P49590 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HARS2P49590 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HARS2P49590 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HARS2P49590 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HARS2P49590 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HARS2P49590 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HARS2P49590 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HARS2P49590 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HARS2P49590 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HARS2P49590 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HARS2P49590 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HARS2P49590 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HARS2P49590 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HARS2P49590 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HARS2P49590 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HARS2P49590 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HARS2P49590 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HARS2P49590 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HARS2P49590 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HARS2P49590 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HARS2P49590 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HARS2P49590 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HARS2P49590 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HARS2P49590 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HARS2P49590 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HARS2P49590 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HARS2P49590 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HARS2P49590 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HARS2P49590 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms