Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC9A3P48764 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC9A3P48764 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC9A3P48764 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A3P48764 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A3P48764 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A3P48764 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A3P48764 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A3P48764 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A3P48764 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC9A3P48764 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC9A3P48764 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A3P48764 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A3P48764 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A3P48764 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A3P48764 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A3P48764 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A3P48764 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A3P48764 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A3P48764 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A3P48764 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A3P48764 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A3P48764 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A3P48764 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A3P48764 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A3P48764 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A3P48764 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A3P48764 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A3P48764 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A3P48764 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A3P48764 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A3P48764 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A3P48764 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A3P48764 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A3P48764 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A3P48764 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A3P48764 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A3P48764 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A3P48764 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A3P48764 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A3P48764 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A3P48764 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A3P48764 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A3P48764 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A3P48764 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A3P48764 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A3P48764 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A3P48764 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A3P48764 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A3P48764 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A3P48764 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC9A3P48764 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC9A3P48764 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A3P48764 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A3P48764 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A3P48764 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A3P48764 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A3P48764 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A3P48764 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A3P48764 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A3P48764 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A3P48764 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A3P48764 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A3P48764 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A3P48764 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A3P48764 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A3P48764 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A3P48764 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC9A3P48764 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC9A3P48764 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC9A3P48764 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC9A3P48764 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC9A3P48764 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC9A3P48764 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A3P48764 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A3P48764 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A3P48764 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A3P48764 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A3P48764 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A3P48764 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC9A3P48764 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC9A3P48764 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC9A3P48764 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC9A3P48764 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC9A3P48764 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC9A3P48764 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC9A3P48764 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC9A3P48764 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC9A3P48764 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC9A3P48764 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC9A3P48764 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC9A3P48764 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC9A3P48764 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC9A3P48764 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC9A3P48764 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC9A3P48764 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC9A3P48764 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC9A3P48764 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC9A3P48764 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC9A3P48764 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms