Protein–RNA interactions for Protein: P48378

RFX2, DNA-binding protein RFX2, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX2P48378 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX2P48378 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX2P48378 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX2P48378 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX2P48378 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX2P48378 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX2P48378 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX2P48378 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX2P48378 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX2P48378 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX2P48378 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX2P48378 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFX2P48378 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX2P48378 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX2P48378 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX2P48378 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX2P48378 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX2P48378 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX2P48378 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX2P48378 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX2P48378 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX2P48378 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX2P48378 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX2P48378 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFX2P48378 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFX2P48378 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX2P48378 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX2P48378 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX2P48378 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX2P48378 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX2P48378 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX2P48378 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX2P48378 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX2P48378 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX2P48378 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX2P48378 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX2P48378 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX2P48378 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX2P48378 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX2P48378 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX2P48378 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX2P48378 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX2P48378 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX2P48378 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX2P48378 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX2P48378 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX2P48378 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX2P48378 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX2P48378 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX2P48378 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX2P48378 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX2P48378 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX2P48378 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX2P48378 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX2P48378 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX2P48378 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX2P48378 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX2P48378 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX2P48378 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX2P48378 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX2P48378 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX2P48378 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX2P48378 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
RFX2P48378 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX2P48378 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX2P48378 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX2P48378 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX2P48378 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX2P48378 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX2P48378 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX2P48378 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX2P48378 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX2P48378 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX2P48378 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFX2P48378 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFX2P48378 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFX2P48378 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFX2P48378 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFX2P48378 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFX2P48378 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFX2P48378 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFX2P48378 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFX2P48378 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFX2P48378 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFX2P48378 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFX2P48378 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFX2P48378 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFX2P48378 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RFX2P48378 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFX2P48378 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFX2P48378 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFX2P48378 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFX2P48378 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFX2P48378 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX2P48378 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX2P48378 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX2P48378 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX2P48378 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX2P48378 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX2P48378 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms