Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIA4P48058 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIA4P48058 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIA4P48058 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIA4P48058 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIA4P48058 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIA4P48058 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIA4P48058 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIA4P48058 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIA4P48058 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIA4P48058 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIA4P48058 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIA4P48058 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIA4P48058 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIA4P48058 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIA4P48058 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIA4P48058 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIA4P48058 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIA4P48058 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIA4P48058 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIA4P48058 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIA4P48058 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIA4P48058 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIA4P48058 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRIA4P48058 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRIA4P48058 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRIA4P48058 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRIA4P48058 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRIA4P48058 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRIA4P48058 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIA4P48058 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIA4P48058 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GRIA4P48058 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRIA4P48058 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRIA4P48058 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIA4P48058 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIA4P48058 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIA4P48058 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIA4P48058 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIA4P48058 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIA4P48058 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIA4P48058 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIA4P48058 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIA4P48058 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIA4P48058 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIA4P48058 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIA4P48058 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIA4P48058 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIA4P48058 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GRIA4P48058 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GRIA4P48058 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIA4P48058 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIA4P48058 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIA4P48058 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIA4P48058 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIA4P48058 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIA4P48058 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIA4P48058 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIA4P48058 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIA4P48058 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIA4P48058 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIA4P48058 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIA4P48058 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIA4P48058 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIA4P48058 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIA4P48058 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIA4P48058 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIA4P48058 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIA4P48058 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIA4P48058 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIA4P48058 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIA4P48058 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GRIA4P48058 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GRIA4P48058 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GRIA4P48058 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GRIA4P48058 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GRIA4P48058 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIA4P48058 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIA4P48058 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIA4P48058 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIA4P48058 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIA4P48058 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIA4P48058 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIA4P48058 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIA4P48058 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIA4P48058 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIA4P48058 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIA4P48058 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIA4P48058 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIA4P48058 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIA4P48058 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIA4P48058 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIA4P48058 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIA4P48058 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIA4P48058 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIA4P48058 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIA4P48058 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIA4P48058 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIA4P48058 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIA4P48058 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms