Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NOP2P46087 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NOP2P46087 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NOP2P46087 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NOP2P46087 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NOP2P46087 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NOP2P46087 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NOP2P46087 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NOP2P46087 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NOP2P46087 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NOP2P46087 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NOP2P46087 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NOP2P46087 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NOP2P46087 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NOP2P46087 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NOP2P46087 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NOP2P46087 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NOP2P46087 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NOP2P46087 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NOP2P46087 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NOP2P46087 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NOP2P46087 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NOP2P46087 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NOP2P46087 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NOP2P46087 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NOP2P46087 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NOP2P46087 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NOP2P46087 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NOP2P46087 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NOP2P46087 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NOP2P46087 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NOP2P46087 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NOP2P46087 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NOP2P46087 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NOP2P46087 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NOP2P46087 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NOP2P46087 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NOP2P46087 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NOP2P46087 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NOP2P46087 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NOP2P46087 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NOP2P46087 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NOP2P46087 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NOP2P46087 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NOP2P46087 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NOP2P46087 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NOP2P46087 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NOP2P46087 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NOP2P46087 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NOP2P46087 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NOP2P46087 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NOP2P46087 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NOP2P46087 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NOP2P46087 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NOP2P46087 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NOP2P46087 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NOP2P46087 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NOP2P46087 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NOP2P46087 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NOP2P46087 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NOP2P46087 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NOP2P46087 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NOP2P46087 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NOP2P46087 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NOP2P46087 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NOP2P46087 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NOP2P46087 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NOP2P46087 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NOP2P46087 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NOP2P46087 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NOP2P46087 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NOP2P46087 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NOP2P46087 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NOP2P46087 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NOP2P46087 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NOP2P46087 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NOP2P46087 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NOP2P46087 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NOP2P46087 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NOP2P46087 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NOP2P46087 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NOP2P46087 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NOP2P46087 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NOP2P46087 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOP2P46087 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOP2P46087 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOP2P46087 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NOP2P46087 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOP2P46087 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOP2P46087 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NOP2P46087 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NOP2P46087 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NOP2P46087 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NOP2P46087 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NOP2P46087 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NOP2P46087 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NOP2P46087 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NOP2P46087 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NOP2P46087 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NOP2P46087 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms