Protein–RNA interactions for Protein: P43639

CKB1, Casein kinase II subunit beta, yeastyeast

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CKB1P43639 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt12.92□□□□□ -0.34
CKB1P43639 SPS100YHR139C 981 nt12.92□□□□□ -0.34
CKB1P43639 NAS2YIL007C 663 nt12.92□□□□□ -0.34
CKB1P43639 KRE1YNL322C 942 nt12.91□□□□□ -0.34
CKB1P43639 YPS3YLR121C 1527 nt12.91□□□□□ -0.34
CKB1P43639 OSH7YHR001W 1314 nt12.9□□□□□ -0.34
CKB1P43639 HEM13YDR044W 987 nt12.9□□□□□ -0.34
CKB1P43639 LSM5YER146W 282 nt12.9□□□□□ -0.34
CKB1P43639 FMS1YMR020W 1527 nt12.89□□□□□ -0.35
CKB1P43639 SOL2YCR073W-A 948 nt12.89□□□□□ -0.35
CKB1P43639 QDR2YIL121W 1629 nt12.88□□□□□ -0.35
CKB1P43639 YCR025CYCR025C 411 nt12.88□□□□□ -0.35
CKB1P43639 SWM1YDR260C 513 nt12.88□□□□□ -0.35
CKB1P43639 RSC8YFR037C 1674 nt12.88□□□□□ -0.35
CKB1P43639 TAT2YOL020W 1779 nt12.84□□□□□ -0.35
CKB1P43639 YDR455CYDR455C 309 nt12.84□□□□□ -0.35
CKB1P43639 LYS20YDL182W 1287 nt12.83□□□□□ -0.36
CKB1P43639 AI5_BETAQ0075 1065 nt12.83□□□□□ -0.36
CKB1P43639 YJL067WYJL067W 351 nt12.82□□□□□ -0.36
CKB1P43639 ACO2YJL200C 2370 nt12.81□□□□□ -0.36
CKB1P43639 BMT5YIL096C 1011 nt12.81□□□□□ -0.36
CKB1P43639 BUD20YLR074C 501 nt12.8□□□□□ -0.36
CKB1P43639 RRT8YOL048C 1029 nt12.78□□□□□ -0.36
CKB1P43639 FLX1YIL134W 936 nt12.77□□□□□ -0.37
CKB1P43639 SRN2YLR119W 642 nt12.77□□□□□ -0.37
CKB1P43639 SPP2YOR148C 558 nt12.77□□□□□ -0.37
CKB1P43639 PAB1YER165W 1734 nt12.76□□□□□ -0.37
CKB1P43639 THP3YPR045C 1413 nt12.75□□□□□ -0.37
CKB1P43639 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt12.74□□□□□ -0.37
CKB1P43639 ACH1YBL015W 1581 nt12.73□□□□□ -0.37
CKB1P43639 TVP23YDR084C 600 nt12.72□□□□□ -0.37
CKB1P43639 ADE8YDR408C 645 nt12.72□□□□□ -0.37
CKB1P43639 PHB2YGR231C 933 nt12.7□□□□□ -0.38
CKB1P43639 ADH3YMR083W 1128 nt12.69□□□□□ -0.38
CKB1P43639 SPE2YOL052C 1191 nt12.69□□□□□ -0.38
CKB1P43639 ERG13YML126C 1476 nt12.69□□□□□ -0.38
CKB1P43639 ASP3-1YLR155C 1089 nt12.65□□□□□ -0.38
CKB1P43639 ASP3-2YLR157C 1089 nt12.65□□□□□ -0.38
CKB1P43639 ASP3-3YLR158C 1089 nt12.65□□□□□ -0.38
CKB1P43639 ASP3-4YLR160C 1089 nt12.65□□□□□ -0.38
CKB1P43639 YMR007WYMR007W 381 nt12.65□□□□□ -0.38
CKB1P43639 CWC15YDR163W 528 nt12.63□□□□□ -0.39
CKB1P43639 SER2YGR208W 930 nt12.63□□□□□ -0.39
CKB1P43639 OPI3YJR073C 621 nt12.63□□□□□ -0.39
CKB1P43639 FSH2YMR222C 672 nt12.62□□□□□ -0.39
CKB1P43639 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt12.59□□□□□ -0.39
CKB1P43639 ALG12YNR030W 1656 nt12.58□□□□□ -0.4
CKB1P43639 MOB1YIL106W 945 nt12.58□□□□□ -0.4
CKB1P43639 RDN25-1RDN25-1 3396 nt12.57□□□□□ -0.4
CKB1P43639 RDN25-2RDN25-2 3396 nt12.57□□□□□ -0.4
CKB1P43639 PBP1YGR178C 2169 nt12.56□□□□□ -0.4
CKB1P43639 YOR343CYOR343C 327 nt12.56□□□□□ -0.4
CKB1P43639 YPL041CYPL041C 624 nt12.56□□□□□ -0.4
CKB1P43639 VPS62YGR141W 1404 nt12.55□□□□□ -0.4
CKB1P43639 TPC1YGR096W 945 nt12.55□□□□□ -0.4
CKB1P43639 CYC3YAL039C 810 nt12.55□□□□□ -0.4
CKB1P43639 RCR1YBR005W 642 nt12.55□□□□□ -0.4
CKB1P43639 BET2YPR176C 978 nt12.55□□□□□ -0.4
CKB1P43639 HTS1YPR033C 1641 nt12.53□□□□□ -0.4
CKB1P43639 SAC7YDR389W 1965 nt12.52□□□□□ -0.4
CKB1P43639 COG1YGL223C 1254 nt12.52□□□□□ -0.41
CKB1P43639 ENO2YHR174W 1314 nt12.51□□□□□ -0.41
CKB1P43639 AMF1YOR378W 1548 nt12.49□□□□□ -0.41
CKB1P43639 RPL12BYDR418W 498 nt12.48□□□□□ -0.41
CKB1P43639 DIG1YPL049C 1359 nt12.47□□□□□ -0.41
CKB1P43639 FTH1YBR207W 1398 nt12.47□□□□□ -0.41
CKB1P43639 YKR012CYKR012C 378 nt12.47□□□□□ -0.41
CKB1P43639 YDL086WYDL086W 822 nt12.46□□□□□ -0.41
CKB1P43639 TGA1tA(UGC)A 73 nt12.46□□□□□ -0.41
CKB1P43639 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt12.46□□□□□ -0.41
CKB1P43639 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt12.46□□□□□ -0.41
CKB1P43639 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt12.46□□□□□ -0.41
CKB1P43639 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt12.46□□□□□ -0.41
CKB1P43639 PCP1YGR101W 1041 nt12.45□□□□□ -0.42
CKB1P43639 YHM2YMR241W 945 nt12.45□□□□□ -0.42
CKB1P43639 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt12.44□□□□□ -0.42
CKB1P43639 AIM1YAL046C 357 nt12.44□□□□□ -0.42
CKB1P43639 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt12.43□□□□□ -0.42
CKB1P43639 YGR210CYGR210C 1236 nt12.43□□□□□ -0.42
CKB1P43639 HRA1HRA1 564 nt12.42□□□□□ -0.42
CKB1P43639 SDS24YBR214W 1584 nt12.42□□□□□ -0.42
CKB1P43639 LSB6YJL100W 1824 nt12.41□□□□□ -0.42
CKB1P43639 GRH1YDR517W 1119 nt12.41□□□□□ -0.42
CKB1P43639 LEU2YCL018W 1095 nt12.41□□□□□ -0.42
CKB1P43639 SRP102YKL154W 735 nt12.4□□□□□ -0.42
CKB1P43639 HMT1YBR034C 1047 nt12.4□□□□□ -0.42
CKB1P43639 ARP10YDR106W 855 nt12.39□□□□□ -0.43
CKB1P43639 CYT2YKL087C 675 nt12.38□□□□□ -0.43
CKB1P43639 FCY1YPR062W 477 nt12.38□□□□□ -0.43
CKB1P43639 NAM8YHR086W 1572 nt12.38□□□□□ -0.43
CKB1P43639 ERO1YML130C 1692 nt12.38□□□□□ -0.43
CKB1P43639 YNR064CYNR064C 873 nt12.37□□□□□ -0.43
CKB1P43639 VBA3YCL069W 1377 nt12.35□□□□□ -0.43
CKB1P43639 YLR280CYLR280C 351 nt12.35□□□□□ -0.43
CKB1P43639 YOR268CYOR268C 399 nt12.35□□□□□ -0.43
CKB1P43639 YTH1YPR107C 627 nt12.34□□□□□ -0.43
CKB1P43639 ENO1YGR254W 1314 nt12.34□□□□□ -0.43
CKB1P43639 EMC3YKL207W 762 nt12.33□□□□□ -0.44
CKB1P43639 UTP6YDR449C 1323 nt12.33□□□□□ -0.44
CKB1P43639 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt12.31□□□□□ -0.44
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