Protein–RNA interactions for Protein: P43487

RANBP1, Ran-specific GTPase-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP1P43487 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RANBP1P43487 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RANBP1P43487 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RANBP1P43487 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RANBP1P43487 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RANBP1P43487 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RANBP1P43487 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RANBP1P43487 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RANBP1P43487 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RANBP1P43487 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RANBP1P43487 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RANBP1P43487 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RANBP1P43487 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RANBP1P43487 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RANBP1P43487 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RANBP1P43487 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RANBP1P43487 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RANBP1P43487 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RANBP1P43487 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RANBP1P43487 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RANBP1P43487 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RANBP1P43487 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RANBP1P43487 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RANBP1P43487 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RANBP1P43487 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RANBP1P43487 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RANBP1P43487 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RANBP1P43487 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RANBP1P43487 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RANBP1P43487 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RANBP1P43487 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RANBP1P43487 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RANBP1P43487 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RANBP1P43487 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RANBP1P43487 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RANBP1P43487 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RANBP1P43487 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RANBP1P43487 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RANBP1P43487 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RANBP1P43487 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RANBP1P43487 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RANBP1P43487 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RANBP1P43487 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RANBP1P43487 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RANBP1P43487 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RANBP1P43487 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RANBP1P43487 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RANBP1P43487 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RANBP1P43487 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RANBP1P43487 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RANBP1P43487 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RANBP1P43487 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RANBP1P43487 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RANBP1P43487 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RANBP1P43487 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RANBP1P43487 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RANBP1P43487 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RANBP1P43487 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RANBP1P43487 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RANBP1P43487 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RANBP1P43487 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
RANBP1P43487 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RANBP1P43487 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RANBP1P43487 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RANBP1P43487 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RANBP1P43487 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RANBP1P43487 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RANBP1P43487 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RANBP1P43487 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RANBP1P43487 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RANBP1P43487 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RANBP1P43487 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RANBP1P43487 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RANBP1P43487 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RANBP1P43487 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RANBP1P43487 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RANBP1P43487 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RANBP1P43487 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RANBP1P43487 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RANBP1P43487 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RANBP1P43487 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RANBP1P43487 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RANBP1P43487 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RANBP1P43487 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RANBP1P43487 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RANBP1P43487 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RANBP1P43487 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RANBP1P43487 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RANBP1P43487 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RANBP1P43487 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RANBP1P43487 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RANBP1P43487 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RANBP1P43487 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RANBP1P43487 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RANBP1P43487 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RANBP1P43487 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RANBP1P43487 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RANBP1P43487 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RANBP1P43487 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RANBP1P43487 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms