Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD52P43351 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD52P43351 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD52P43351 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD52P43351 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD52P43351 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD52P43351 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD52P43351 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD52P43351 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD52P43351 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD52P43351 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD52P43351 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD52P43351 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD52P43351 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD52P43351 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD52P43351 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD52P43351 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD52P43351 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD52P43351 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD52P43351 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD52P43351 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD52P43351 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD52P43351 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD52P43351 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD52P43351 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD52P43351 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD52P43351 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD52P43351 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD52P43351 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD52P43351 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD52P43351 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD52P43351 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD52P43351 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD52P43351 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD52P43351 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD52P43351 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD52P43351 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD52P43351 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD52P43351 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD52P43351 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD52P43351 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD52P43351 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD52P43351 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD52P43351 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD52P43351 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD52P43351 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD52P43351 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD52P43351 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD52P43351 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD52P43351 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD52P43351 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD52P43351 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD52P43351 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD52P43351 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD52P43351 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD52P43351 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD52P43351 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD52P43351 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD52P43351 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD52P43351 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD52P43351 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD52P43351 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD52P43351 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD52P43351 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD52P43351 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD52P43351 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAD52P43351 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD52P43351 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD52P43351 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD52P43351 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD52P43351 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD52P43351 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD52P43351 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD52P43351 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD52P43351 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD52P43351 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD52P43351 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD52P43351 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD52P43351 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD52P43351 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD52P43351 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD52P43351 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD52P43351 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD52P43351 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD52P43351 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD52P43351 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD52P43351 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD52P43351 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD52P43351 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD52P43351 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAD52P43351 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAD52P43351 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD52P43351 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD52P43351 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD52P43351 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD52P43351 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD52P43351 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD52P43351 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD52P43351 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD52P43351 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms