Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIA2P42262 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIA2P42262 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIA2P42262 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIA2P42262 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIA2P42262 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIA2P42262 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIA2P42262 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIA2P42262 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIA2P42262 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIA2P42262 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIA2P42262 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIA2P42262 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIA2P42262 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIA2P42262 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIA2P42262 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIA2P42262 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIA2P42262 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIA2P42262 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIA2P42262 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIA2P42262 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIA2P42262 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIA2P42262 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIA2P42262 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIA2P42262 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIA2P42262 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIA2P42262 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIA2P42262 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIA2P42262 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIA2P42262 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIA2P42262 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIA2P42262 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIA2P42262 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIA2P42262 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIA2P42262 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIA2P42262 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIA2P42262 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIA2P42262 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
GRIA2P42262 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIA2P42262 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIA2P42262 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIA2P42262 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIA2P42262 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GRIA2P42262 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GRIA2P42262 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIA2P42262 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIA2P42262 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIA2P42262 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIA2P42262 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIA2P42262 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIA2P42262 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIA2P42262 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIA2P42262 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIA2P42262 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIA2P42262 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIA2P42262 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIA2P42262 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIA2P42262 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIA2P42262 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIA2P42262 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIA2P42262 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIA2P42262 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GRIA2P42262 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GRIA2P42262 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GRIA2P42262 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIA2P42262 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIA2P42262 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIA2P42262 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIA2P42262 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIA2P42262 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIA2P42262 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIA2P42262 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIA2P42262 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GRIA2P42262 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GRIA2P42262 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GRIA2P42262 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GRIA2P42262 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GRIA2P42262 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GRIA2P42262 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GRIA2P42262 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRIA2P42262 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRIA2P42262 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRIA2P42262 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIA2P42262 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIA2P42262 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIA2P42262 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIA2P42262 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIA2P42262 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIA2P42262 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIA2P42262 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIA2P42262 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIA2P42262 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIA2P42262 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIA2P42262 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIA2P42262 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIA2P42262 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIA2P42262 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIA2P42262 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIA2P42262 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIA2P42262 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms