Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 CCT5YJR064W 1689 nt9.48□□□□□ -0.89
VFA1P40080 PSD1YNL169C 1503 nt9.47□□□□□ -0.89
VFA1P40080 TIM44YIL022W 1296 nt9.47□□□□□ -0.89
VFA1P40080 YPR126CYPR126C 309 nt9.47□□□□□ -0.89
VFA1P40080 YJR114WYJR114W 393 nt9.46□□□□□ -0.9
VFA1P40080 CWP2YKL096W-A 279 nt9.45□□□□□ -0.9
VFA1P40080 YNR064CYNR064C 873 nt9.45□□□□□ -0.9
VFA1P40080 OPI3YJR073C 621 nt9.44□□□□□ -0.9
VFA1P40080 MDM35YKL053C-A 261 nt9.44□□□□□ -0.9
VFA1P40080 FUN14YAL008W 597 nt9.42□□□□□ -0.9
VFA1P40080 SNX3YOR357C 489 nt9.42□□□□□ -0.9
VFA1P40080 THI72YOR192C 1800 nt9.41□□□□□ -0.9
VFA1P40080 CTI6YPL181W 1521 nt9.41□□□□□ -0.9
VFA1P40080 CYT1YOR065W 930 nt9.4□□□□□ -0.9
VFA1P40080 ACO2YJL200C 2370 nt9.39□□□□□ -0.91
VFA1P40080 SPS100YHR139C 981 nt9.39□□□□□ -0.91
VFA1P40080 TVP23YDR084C 600 nt9.38□□□□□ -0.91
VFA1P40080 YEL008WYEL008W 381 nt9.38□□□□□ -0.91
VFA1P40080 YMR262WYMR262W 942 nt9.38□□□□□ -0.91
VFA1P40080 IML3YBR107C 738 nt9.38□□□□□ -0.91
VFA1P40080 HXT10YFL011W 1641 nt9.38□□□□□ -0.91
VFA1P40080 YHR218WYHR218W 1812 nt9.38□□□□□ -0.91
VFA1P40080 SUV3YPL029W 2214 nt9.37□□□□□ -0.91
VFA1P40080 YMR265CYMR265C 1386 nt9.37□□□□□ -0.91
VFA1P40080 RPC31YNL151C 756 nt9.37□□□□□ -0.91
VFA1P40080 KEL3YPL263C 1956 nt9.35□□□□□ -0.91
VFA1P40080 HAP5YOR358W 729 nt9.35□□□□□ -0.91
VFA1P40080 DPL1YDR294C 1770 nt9.35□□□□□ -0.91
VFA1P40080 SFL1YOR140W 2301 nt9.34□□□□□ -0.91
VFA1P40080 RIM2YBR192W 1134 nt9.34□□□□□ -0.91
VFA1P40080 ABZ2YMR289W 1125 nt9.31□□□□□ -0.92
VFA1P40080 MHF1YOL086W-A 273 nt9.3□□□□□ -0.92
VFA1P40080 CRC1YOR100C 984 nt9.3□□□□□ -0.92
VFA1P40080 MET1YKR069W 1782 nt9.29□□□□□ -0.92
VFA1P40080 RPN14YGL004C 1254 nt9.29□□□□□ -0.92
VFA1P40080 SWT21YNL187W 1074 nt9.29□□□□□ -0.92
VFA1P40080 ENO2YHR174W 1314 nt9.29□□□□□ -0.92
VFA1P40080 STE4YOR212W 1272 nt9.28□□□□□ -0.92
VFA1P40080 LEU4YNL104C 1860 nt9.28□□□□□ -0.92
VFA1P40080 TAF13YML098W 504 nt9.27□□□□□ -0.93
VFA1P40080 RPM1RPM1 483 nt9.27□□□□□ -0.93
VFA1P40080 AGP3YFL055W 1677 nt9.26□□□□□ -0.93
VFA1P40080 KRR1YCL059C 951 nt9.26□□□□□ -0.93
VFA1P40080 AMF1YOR378W 1548 nt9.26□□□□□ -0.93
VFA1P40080 PCP1YGR101W 1041 nt9.25□□□□□ -0.93
VFA1P40080 POT1YIL160C 1254 nt9.25□□□□□ -0.93
VFA1P40080 FRE6YLL051C 2139 nt9.25□□□□□ -0.93
VFA1P40080 YKL053WYKL053W 375 nt9.24□□□□□ -0.93
VFA1P40080 YLR349WYLR349W 507 nt9.24□□□□□ -0.93
VFA1P40080 snR31snR31 225 nt9.24□□□□□ -0.93
VFA1P40080 YHL008CYHL008C 1884 nt9.23□□□□□ -0.93
VFA1P40080 TPC1YGR096W 945 nt9.22□□□□□ -0.93
VFA1P40080 YDR467CYDR467C 327 nt9.21□□□□□ -0.94
VFA1P40080 KGD2YDR148C 1392 nt9.2□□□□□ -0.94
VFA1P40080 CPD1YGR247W 720 nt9.19□□□□□ -0.94
VFA1P40080 INH1YDL181W 258 nt9.18□□□□□ -0.94
VFA1P40080 RAD51YER095W 1203 nt9.18□□□□□ -0.94
VFA1P40080 APS2YJR058C 444 nt9.18□□□□□ -0.94
VFA1P40080 NIF3YGL221C 867 nt9.17□□□□□ -0.94
VFA1P40080 NPP2YEL016C 1482 nt9.16□□□□□ -0.94
VFA1P40080 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt9.15□□□□□ -0.94
VFA1P40080 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt9.15□□□□□ -0.94
VFA1P40080 NAM8YHR086W 1572 nt9.14□□□□□ -0.95
VFA1P40080 SAN1YDR143C 1833 nt9.13□□□□□ -0.95
VFA1P40080 ADH7YCR105W 1086 nt9.13□□□□□ -0.95
VFA1P40080 GPM1YKL152C 744 nt9.13□□□□□ -0.95
VFA1P40080 SPE2YOL052C 1191 nt9.13□□□□□ -0.95
VFA1P40080 TUB4YLR212C 1422 nt9.13□□□□□ -0.95
VFA1P40080 LEU2YCL018W 1095 nt9.12□□□□□ -0.95
VFA1P40080 GSF2YML048W 1212 nt9.11□□□□□ -0.95
VFA1P40080 KRE1YNL322C 942 nt9.11□□□□□ -0.95
VFA1P40080 THI3YDL080C 1830 nt9.1□□□□□ -0.95
VFA1P40080 NAS2YIL007C 663 nt9.1□□□□□ -0.95
VFA1P40080 SRP54YPR088C 1626 nt9.09□□□□□ -0.95
VFA1P40080 PAU15YIR041W 375 nt9.09□□□□□ -0.95
VFA1P40080 NBA1YOL070C 1506 nt9.09□□□□□ -0.95
VFA1P40080 SBP1YHL034C 885 nt9.08□□□□□ -0.96
VFA1P40080 YBL095WYBL095W 813 nt9.08□□□□□ -0.96
VFA1P40080 TPO4YOR273C 1980 nt9.08□□□□□ -0.96
VFA1P40080 PAU5YFL020C 369 nt9.06□□□□□ -0.96
VFA1P40080 GGA2YHR108W 1758 nt9.06□□□□□ -0.96
VFA1P40080 FET5YFL041W 1869 nt9.06□□□□□ -0.96
VFA1P40080 REX2YLR059C 810 nt9.05□□□□□ -0.96
VFA1P40080 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt9.04□□□□□ -0.96
VFA1P40080 MTO1YGL236C 2010 nt9.04□□□□□ -0.96
VFA1P40080 CDD1YLR245C 429 nt9.03□□□□□ -0.96
VFA1P40080 YMC2YBR104W 990 nt9.03□□□□□ -0.96
VFA1P40080 THP3YPR045C 1413 nt9.03□□□□□ -0.96
VFA1P40080 AAT1YKL106W 1356 nt9.02□□□□□ -0.97
VFA1P40080 TRP2YER090W 1524 nt9.01□□□□□ -0.97
VFA1P40080 PTC6YCR079W 1329 nt9.01□□□□□ -0.97
VFA1P40080 GAS1YMR307W 1680 nt9□□□□□ -0.97
VFA1P40080 YKR012CYKR012C 378 nt9□□□□□ -0.97
VFA1P40080 PGC1YPL206C 966 nt9□□□□□ -0.97
VFA1P40080 ESS1YJR017C 513 nt8.99□□□□□ -0.97
VFA1P40080 MET2YNL277W 1461 nt8.98□□□□□ -0.97
VFA1P40080 THI6YPL214C 1623 nt8.98□□□□□ -0.97
VFA1P40080 FSH2YMR222C 672 nt8.97□□□□□ -0.97
VFA1P40080 IGD1YFR017C 588 nt8.95□□□□□ -0.98
VFA1P40080 MRS4YKR052C 915 nt8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.4 ms