Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHI3L1P36222 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHI3L1P36222 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHI3L1P36222 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHI3L1P36222 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHI3L1P36222 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHI3L1P36222 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHI3L1P36222 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHI3L1P36222 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHI3L1P36222 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHI3L1P36222 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHI3L1P36222 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CHI3L1P36222 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHI3L1P36222 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHI3L1P36222 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHI3L1P36222 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHI3L1P36222 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHI3L1P36222 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHI3L1P36222 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHI3L1P36222 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHI3L1P36222 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHI3L1P36222 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHI3L1P36222 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHI3L1P36222 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHI3L1P36222 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHI3L1P36222 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHI3L1P36222 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHI3L1P36222 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHI3L1P36222 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CHI3L1P36222 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHI3L1P36222 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHI3L1P36222 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHI3L1P36222 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHI3L1P36222 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHI3L1P36222 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHI3L1P36222 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHI3L1P36222 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHI3L1P36222 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHI3L1P36222 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHI3L1P36222 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHI3L1P36222 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHI3L1P36222 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHI3L1P36222 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHI3L1P36222 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHI3L1P36222 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHI3L1P36222 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHI3L1P36222 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHI3L1P36222 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHI3L1P36222 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHI3L1P36222 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHI3L1P36222 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CHI3L1P36222 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHI3L1P36222 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHI3L1P36222 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CHI3L1P36222 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHI3L1P36222 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHI3L1P36222 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHI3L1P36222 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHI3L1P36222 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHI3L1P36222 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHI3L1P36222 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHI3L1P36222 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CHI3L1P36222 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHI3L1P36222 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHI3L1P36222 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHI3L1P36222 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHI3L1P36222 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHI3L1P36222 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CHI3L1P36222 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHI3L1P36222 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHI3L1P36222 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHI3L1P36222 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHI3L1P36222 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHI3L1P36222 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHI3L1P36222 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHI3L1P36222 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHI3L1P36222 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHI3L1P36222 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHI3L1P36222 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHI3L1P36222 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CHI3L1P36222 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHI3L1P36222 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHI3L1P36222 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHI3L1P36222 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHI3L1P36222 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHI3L1P36222 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHI3L1P36222 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHI3L1P36222 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHI3L1P36222 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHI3L1P36222 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHI3L1P36222 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHI3L1P36222 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHI3L1P36222 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHI3L1P36222 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHI3L1P36222 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHI3L1P36222 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHI3L1P36222 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHI3L1P36222 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHI3L1P36222 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHI3L1P36222 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms