Protein–RNA interactions for Protein: P35712

SOX6, Transcription factor SOX-6, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX6P35712 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX6P35712 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX6P35712 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX6P35712 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX6P35712 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX6P35712 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX6P35712 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX6P35712 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX6P35712 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX6P35712 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX6P35712 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SOX6P35712 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX6P35712 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX6P35712 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX6P35712 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX6P35712 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX6P35712 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX6P35712 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX6P35712 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX6P35712 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX6P35712 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX6P35712 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX6P35712 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX6P35712 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX6P35712 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX6P35712 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX6P35712 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SOX6P35712 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX6P35712 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX6P35712 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX6P35712 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX6P35712 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX6P35712 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX6P35712 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX6P35712 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX6P35712 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX6P35712 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX6P35712 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX6P35712 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX6P35712 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX6P35712 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX6P35712 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX6P35712 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX6P35712 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX6P35712 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX6P35712 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX6P35712 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SOX6P35712 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX6P35712 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX6P35712 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX6P35712 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX6P35712 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX6P35712 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX6P35712 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX6P35712 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX6P35712 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX6P35712 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOX6P35712 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOX6P35712 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX6P35712 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX6P35712 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX6P35712 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOX6P35712 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOX6P35712 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOX6P35712 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOX6P35712 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOX6P35712 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOX6P35712 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOX6P35712 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOX6P35712 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOX6P35712 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOX6P35712 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOX6P35712 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOX6P35712 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOX6P35712 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOX6P35712 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX6P35712 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX6P35712 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX6P35712 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX6P35712 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX6P35712 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX6P35712 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX6P35712 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX6P35712 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX6P35712 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX6P35712 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX6P35712 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX6P35712 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX6P35712 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX6P35712 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX6P35712 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX6P35712 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX6P35712 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOX6P35712 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX6P35712 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX6P35712 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX6P35712 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX6P35712 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX6P35712 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX6P35712 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms