Protein–RNA interactions for Protein: P35523

CLCN1, Chloride channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN1P35523 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CLCN1P35523 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLCN1P35523 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLCN1P35523 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLCN1P35523 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLCN1P35523 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLCN1P35523 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLCN1P35523 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLCN1P35523 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLCN1P35523 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLCN1P35523 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLCN1P35523 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLCN1P35523 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLCN1P35523 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CLCN1P35523 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLCN1P35523 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLCN1P35523 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLCN1P35523 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLCN1P35523 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLCN1P35523 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLCN1P35523 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLCN1P35523 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLCN1P35523 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLCN1P35523 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLCN1P35523 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLCN1P35523 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CLCN1P35523 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CLCN1P35523 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLCN1P35523 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLCN1P35523 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLCN1P35523 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLCN1P35523 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLCN1P35523 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLCN1P35523 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLCN1P35523 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLCN1P35523 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLCN1P35523 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLCN1P35523 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLCN1P35523 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLCN1P35523 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLCN1P35523 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLCN1P35523 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLCN1P35523 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLCN1P35523 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLCN1P35523 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLCN1P35523 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLCN1P35523 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLCN1P35523 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLCN1P35523 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLCN1P35523 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLCN1P35523 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLCN1P35523 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLCN1P35523 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLCN1P35523 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLCN1P35523 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLCN1P35523 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLCN1P35523 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLCN1P35523 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLCN1P35523 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLCN1P35523 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLCN1P35523 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLCN1P35523 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLCN1P35523 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLCN1P35523 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLCN1P35523 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLCN1P35523 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLCN1P35523 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLCN1P35523 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLCN1P35523 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLCN1P35523 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLCN1P35523 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLCN1P35523 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLCN1P35523 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLCN1P35523 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLCN1P35523 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLCN1P35523 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLCN1P35523 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLCN1P35523 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLCN1P35523 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLCN1P35523 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLCN1P35523 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLCN1P35523 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLCN1P35523 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLCN1P35523 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLCN1P35523 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLCN1P35523 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLCN1P35523 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLCN1P35523 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLCN1P35523 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLCN1P35523 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CLCN1P35523 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLCN1P35523 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLCN1P35523 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLCN1P35523 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLCN1P35523 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CLCN1P35523 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLCN1P35523 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLCN1P35523 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLCN1P35523 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLCN1P35523 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms