Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXD12P35452 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXD12P35452 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXD12P35452 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXD12P35452 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXD12P35452 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXD12P35452 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXD12P35452 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXD12P35452 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXD12P35452 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXD12P35452 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXD12P35452 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXD12P35452 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXD12P35452 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXD12P35452 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXD12P35452 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXD12P35452 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXD12P35452 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXD12P35452 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXD12P35452 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXD12P35452 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXD12P35452 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXD12P35452 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXD12P35452 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXD12P35452 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXD12P35452 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXD12P35452 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXD12P35452 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXD12P35452 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXD12P35452 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXD12P35452 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXD12P35452 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXD12P35452 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXD12P35452 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXD12P35452 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXD12P35452 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXD12P35452 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXD12P35452 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXD12P35452 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXD12P35452 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXD12P35452 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXD12P35452 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXD12P35452 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXD12P35452 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXD12P35452 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXD12P35452 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXD12P35452 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXD12P35452 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXD12P35452 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXD12P35452 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXD12P35452 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXD12P35452 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXD12P35452 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD12P35452 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD12P35452 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD12P35452 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD12P35452 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD12P35452 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD12P35452 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD12P35452 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD12P35452 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD12P35452 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD12P35452 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD12P35452 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD12P35452 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXD12P35452 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXD12P35452 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXD12P35452 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXD12P35452 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXD12P35452 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXD12P35452 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXD12P35452 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXD12P35452 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXD12P35452 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXD12P35452 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXD12P35452 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXD12P35452 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXD12P35452 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXD12P35452 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXD12P35452 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXD12P35452 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXD12P35452 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXD12P35452 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXD12P35452 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXD12P35452 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXD12P35452 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXD12P35452 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXD12P35452 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXD12P35452 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXD12P35452 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXD12P35452 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXD12P35452 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXD12P35452 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXD12P35452 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXD12P35452 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD12P35452 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD12P35452 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD12P35452 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD12P35452 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD12P35452 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms