Protein–RNA interactions for Protein: P32971

TNFSF8, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF8P32971 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNFSF8P32971 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNFSF8P32971 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFSF8P32971 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFSF8P32971 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFSF8P32971 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFSF8P32971 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFSF8P32971 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFSF8P32971 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF8P32971 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF8P32971 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF8P32971 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF8P32971 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFSF8P32971 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFSF8P32971 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFSF8P32971 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFSF8P32971 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFSF8P32971 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFSF8P32971 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFSF8P32971 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFSF8P32971 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFSF8P32971 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFSF8P32971 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFSF8P32971 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF8P32971 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF8P32971 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF8P32971 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF8P32971 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFSF8P32971 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFSF8P32971 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF8P32971 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF8P32971 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF8P32971 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF8P32971 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF8P32971 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF8P32971 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF8P32971 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF8P32971 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFSF8P32971 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF8P32971 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF8P32971 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF8P32971 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF8P32971 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF8P32971 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF8P32971 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF8P32971 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF8P32971 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF8P32971 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF8P32971 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF8P32971 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF8P32971 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFSF8P32971 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFSF8P32971 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFSF8P32971 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFSF8P32971 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFSF8P32971 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFSF8P32971 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFSF8P32971 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFSF8P32971 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFSF8P32971 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFSF8P32971 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF8P32971 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF8P32971 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF8P32971 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF8P32971 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF8P32971 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFSF8P32971 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFSF8P32971 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNFSF8P32971 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNFSF8P32971 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFSF8P32971 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFSF8P32971 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFSF8P32971 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF8P32971 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF8P32971 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF8P32971 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF8P32971 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF8P32971 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF8P32971 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF8P32971 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFSF8P32971 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF8P32971 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF8P32971 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF8P32971 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF8P32971 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF8P32971 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF8P32971 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFSF8P32971 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNFSF8P32971 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF8P32971 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF8P32971 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF8P32971 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF8P32971 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF8P32971 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF8P32971 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF8P32971 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF8P32971 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF8P32971 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF8P32971 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF8P32971 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms