Protein–RNA interactions for Protein: P32881

IFNA8, Interferon alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA8P32881 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNA8P32881 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNA8P32881 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNA8P32881 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFNA8P32881 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFNA8P32881 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFNA8P32881 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFNA8P32881 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFNA8P32881 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFNA8P32881 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFNA8P32881 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFNA8P32881 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFNA8P32881 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFNA8P32881 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFNA8P32881 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFNA8P32881 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFNA8P32881 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFNA8P32881 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFNA8P32881 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFNA8P32881 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFNA8P32881 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFNA8P32881 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFNA8P32881 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNA8P32881 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNA8P32881 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNA8P32881 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNA8P32881 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNA8P32881 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNA8P32881 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNA8P32881 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNA8P32881 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNA8P32881 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNA8P32881 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNA8P32881 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNA8P32881 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNA8P32881 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNA8P32881 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNA8P32881 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNA8P32881 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNA8P32881 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNA8P32881 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNA8P32881 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNA8P32881 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNA8P32881 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNA8P32881 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFNA8P32881 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNA8P32881 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNA8P32881 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNA8P32881 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFNA8P32881 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFNA8P32881 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFNA8P32881 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNA8P32881 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNA8P32881 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNA8P32881 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNA8P32881 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNA8P32881 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNA8P32881 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFNA8P32881 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFNA8P32881 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFNA8P32881 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFNA8P32881 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFNA8P32881 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFNA8P32881 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFNA8P32881 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFNA8P32881 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFNA8P32881 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFNA8P32881 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IFNA8P32881 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IFNA8P32881 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
IFNA8P32881 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24■■□□□ 1.43
IFNA8P32881 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IFNA8P32881 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFNA8P32881 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFNA8P32881 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFNA8P32881 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFNA8P32881 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFNA8P32881 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFNA8P32881 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFNA8P32881 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFNA8P32881 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFNA8P32881 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFNA8P32881 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFNA8P32881 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFNA8P32881 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFNA8P32881 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFNA8P32881 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFNA8P32881 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
IFNA8P32881 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFNA8P32881 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFNA8P32881 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFNA8P32881 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFNA8P32881 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFNA8P32881 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IFNA8P32881 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFNA8P32881 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFNA8P32881 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFNA8P32881 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFNA8P32881 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFNA8P32881 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms