Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCKBRP32239 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCKBRP32239 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCKBRP32239 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCKBRP32239 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCKBRP32239 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCKBRP32239 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCKBRP32239 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCKBRP32239 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCKBRP32239 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCKBRP32239 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCKBRP32239 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCKBRP32239 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCKBRP32239 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCKBRP32239 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCKBRP32239 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCKBRP32239 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCKBRP32239 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCKBRP32239 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCKBRP32239 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCKBRP32239 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCKBRP32239 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCKBRP32239 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCKBRP32239 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCKBRP32239 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCKBRP32239 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCKBRP32239 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCKBRP32239 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCKBRP32239 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCKBRP32239 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCKBRP32239 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCKBRP32239 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCKBRP32239 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCKBRP32239 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCKBRP32239 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCKBRP32239 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCKBRP32239 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCKBRP32239 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCKBRP32239 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCKBRP32239 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCKBRP32239 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCKBRP32239 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCKBRP32239 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCKBRP32239 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCKBRP32239 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCKBRP32239 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCKBRP32239 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCKBRP32239 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCKBRP32239 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCKBRP32239 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCKBRP32239 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCKBRP32239 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCKBRP32239 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCKBRP32239 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCKBRP32239 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCKBRP32239 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCKBRP32239 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCKBRP32239 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCKBRP32239 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCKBRP32239 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCKBRP32239 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCKBRP32239 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCKBRP32239 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCKBRP32239 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCKBRP32239 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCKBRP32239 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCKBRP32239 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCKBRP32239 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCKBRP32239 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCKBRP32239 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCKBRP32239 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCKBRP32239 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCKBRP32239 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCKBRP32239 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCKBRP32239 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCKBRP32239 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCKBRP32239 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCKBRP32239 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCKBRP32239 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCKBRP32239 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCKBRP32239 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCKBRP32239 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCKBRP32239 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCKBRP32239 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCKBRP32239 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCKBRP32239 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCKBRP32239 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCKBRP32239 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCKBRP32239 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCKBRP32239 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCKBRP32239 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCKBRP32239 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCKBRP32239 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCKBRP32239 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCKBRP32239 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCKBRP32239 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CCKBRP32239 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCKBRP32239 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCKBRP32239 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCKBRP32239 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms