Protein–RNA interactions for Protein: P30533

LRPAP1, Alpha-2-macroglobulin receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPAP1P30533 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRPAP1P30533 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRPAP1P30533 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRPAP1P30533 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRPAP1P30533 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRPAP1P30533 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRPAP1P30533 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRPAP1P30533 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LRPAP1P30533 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRPAP1P30533 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRPAP1P30533 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRPAP1P30533 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRPAP1P30533 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
LRPAP1P30533 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LRPAP1P30533 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRPAP1P30533 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRPAP1P30533 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRPAP1P30533 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRPAP1P30533 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRPAP1P30533 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRPAP1P30533 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRPAP1P30533 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRPAP1P30533 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRPAP1P30533 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRPAP1P30533 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRPAP1P30533 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRPAP1P30533 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRPAP1P30533 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRPAP1P30533 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRPAP1P30533 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRPAP1P30533 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LRPAP1P30533 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRPAP1P30533 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRPAP1P30533 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRPAP1P30533 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRPAP1P30533 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRPAP1P30533 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRPAP1P30533 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRPAP1P30533 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRPAP1P30533 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRPAP1P30533 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRPAP1P30533 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRPAP1P30533 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRPAP1P30533 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRPAP1P30533 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRPAP1P30533 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRPAP1P30533 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRPAP1P30533 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRPAP1P30533 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRPAP1P30533 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRPAP1P30533 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRPAP1P30533 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRPAP1P30533 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRPAP1P30533 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRPAP1P30533 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRPAP1P30533 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRPAP1P30533 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRPAP1P30533 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRPAP1P30533 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRPAP1P30533 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRPAP1P30533 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRPAP1P30533 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRPAP1P30533 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LRPAP1P30533 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRPAP1P30533 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRPAP1P30533 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRPAP1P30533 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRPAP1P30533 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRPAP1P30533 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRPAP1P30533 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRPAP1P30533 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRPAP1P30533 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRPAP1P30533 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRPAP1P30533 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRPAP1P30533 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRPAP1P30533 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRPAP1P30533 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRPAP1P30533 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRPAP1P30533 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRPAP1P30533 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRPAP1P30533 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRPAP1P30533 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LRPAP1P30533 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LRPAP1P30533 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LRPAP1P30533 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRPAP1P30533 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRPAP1P30533 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRPAP1P30533 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LRPAP1P30533 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRPAP1P30533 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRPAP1P30533 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRPAP1P30533 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LRPAP1P30533 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRPAP1P30533 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LRPAP1P30533 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRPAP1P30533 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRPAP1P30533 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRPAP1P30533 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRPAP1P30533 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRPAP1P30533 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms