Protein–RNA interactions for Protein: P28356

HOXD9, Homeobox protein Hox-D9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9P28356 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXD9P28356 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXD9P28356 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXD9P28356 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXD9P28356 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXD9P28356 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXD9P28356 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXD9P28356 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXD9P28356 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HOXD9P28356 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXD9P28356 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXD9P28356 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXD9P28356 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXD9P28356 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXD9P28356 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXD9P28356 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXD9P28356 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXD9P28356 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXD9P28356 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXD9P28356 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXD9P28356 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXD9P28356 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXD9P28356 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXD9P28356 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXD9P28356 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXD9P28356 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXD9P28356 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXD9P28356 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXD9P28356 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXD9P28356 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXD9P28356 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXD9P28356 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXD9P28356 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXD9P28356 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXD9P28356 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXD9P28356 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXD9P28356 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXD9P28356 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXD9P28356 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXD9P28356 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXD9P28356 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXD9P28356 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXD9P28356 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXD9P28356 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXD9P28356 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXD9P28356 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXD9P28356 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXD9P28356 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXD9P28356 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXD9P28356 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXD9P28356 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXD9P28356 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXD9P28356 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXD9P28356 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXD9P28356 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXD9P28356 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXD9P28356 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXD9P28356 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXD9P28356 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXD9P28356 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HOXD9P28356 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXD9P28356 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXD9P28356 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXD9P28356 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXD9P28356 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXD9P28356 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXD9P28356 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXD9P28356 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
HOXD9P28356 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXD9P28356 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXD9P28356 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXD9P28356 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXD9P28356 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXD9P28356 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXD9P28356 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXD9P28356 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXD9P28356 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXD9P28356 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXD9P28356 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXD9P28356 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXD9P28356 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXD9P28356 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXD9P28356 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXD9P28356 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXD9P28356 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXD9P28356 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXD9P28356 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXD9P28356 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXD9P28356 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXD9P28356 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXD9P28356 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXD9P28356 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXD9P28356 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXD9P28356 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXD9P28356 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXD9P28356 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXD9P28356 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXD9P28356 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXD9P28356 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXD9P28356 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms