Protein–RNA interactions for Protein: P28222

HTR1B, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1BP28222 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HTR1BP28222 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HTR1BP28222 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HTR1BP28222 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HTR1BP28222 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HTR1BP28222 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HTR1BP28222 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HTR1BP28222 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HTR1BP28222 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HTR1BP28222 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HTR1BP28222 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HTR1BP28222 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HTR1BP28222 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HTR1BP28222 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HTR1BP28222 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HTR1BP28222 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HTR1BP28222 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HTR1BP28222 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HTR1BP28222 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HTR1BP28222 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HTR1BP28222 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HTR1BP28222 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HTR1BP28222 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HTR1BP28222 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HTR1BP28222 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HTR1BP28222 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HTR1BP28222 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HTR1BP28222 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HTR1BP28222 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HTR1BP28222 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HTR1BP28222 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HTR1BP28222 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HTR1BP28222 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HTR1BP28222 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HTR1BP28222 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HTR1BP28222 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HTR1BP28222 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HTR1BP28222 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HTR1BP28222 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HTR1BP28222 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HTR1BP28222 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HTR1BP28222 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HTR1BP28222 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HTR1BP28222 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HTR1BP28222 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HTR1BP28222 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HTR1BP28222 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HTR1BP28222 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HTR1BP28222 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HTR1BP28222 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HTR1BP28222 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HTR1BP28222 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HTR1BP28222 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HTR1BP28222 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HTR1BP28222 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HTR1BP28222 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HTR1BP28222 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HTR1BP28222 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HTR1BP28222 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HTR1BP28222 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HTR1BP28222 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HTR1BP28222 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HTR1BP28222 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HTR1BP28222 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HTR1BP28222 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HTR1BP28222 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HTR1BP28222 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HTR1BP28222 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HTR1BP28222 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HTR1BP28222 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HTR1BP28222 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HTR1BP28222 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HTR1BP28222 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HTR1BP28222 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HTR1BP28222 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HTR1BP28222 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HTR1BP28222 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HTR1BP28222 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HTR1BP28222 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HTR1BP28222 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HTR1BP28222 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HTR1BP28222 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HTR1BP28222 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HTR1BP28222 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HTR1BP28222 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HTR1BP28222 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HTR1BP28222 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HTR1BP28222 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HTR1BP28222 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HTR1BP28222 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HTR1BP28222 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HTR1BP28222 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HTR1BP28222 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HTR1BP28222 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HTR1BP28222 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HTR1BP28222 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HTR1BP28222 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HTR1BP28222 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HTR1BP28222 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HTR1BP28222 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms