Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PDE4AP27815 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PDE4AP27815 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PDE4AP27815 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PDE4AP27815 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PDE4AP27815 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PDE4AP27815 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PDE4AP27815 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PDE4AP27815 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PDE4AP27815 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
PDE4AP27815 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PDE4AP27815 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PDE4AP27815 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PDE4AP27815 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PDE4AP27815 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PDE4AP27815 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PDE4AP27815 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PDE4AP27815 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PDE4AP27815 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PDE4AP27815 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PDE4AP27815 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PDE4AP27815 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PDE4AP27815 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PDE4AP27815 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PDE4AP27815 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PDE4AP27815 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PDE4AP27815 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PDE4AP27815 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PDE4AP27815 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PDE4AP27815 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
PDE4AP27815 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PDE4AP27815 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PDE4AP27815 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PDE4AP27815 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PDE4AP27815 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PDE4AP27815 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PDE4AP27815 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PDE4AP27815 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PDE4AP27815 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PDE4AP27815 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
PDE4AP27815 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PDE4AP27815 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PDE4AP27815 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PDE4AP27815 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PDE4AP27815 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PDE4AP27815 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PDE4AP27815 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PDE4AP27815 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PDE4AP27815 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PDE4AP27815 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PDE4AP27815 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PDE4AP27815 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
PDE4AP27815 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
PDE4AP27815 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PDE4AP27815 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PDE4AP27815 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PDE4AP27815 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
PDE4AP27815 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PDE4AP27815 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PDE4AP27815 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PDE4AP27815 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PDE4AP27815 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PDE4AP27815 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PDE4AP27815 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PDE4AP27815 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PDE4AP27815 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PDE4AP27815 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PDE4AP27815 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PDE4AP27815 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PDE4AP27815 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PDE4AP27815 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PDE4AP27815 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PDE4AP27815 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PDE4AP27815 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PDE4AP27815 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PDE4AP27815 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PDE4AP27815 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PDE4AP27815 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PDE4AP27815 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PDE4AP27815 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PDE4AP27815 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PDE4AP27815 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PDE4AP27815 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PDE4AP27815 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PDE4AP27815 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PDE4AP27815 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
PDE4AP27815 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
PDE4AP27815 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PDE4AP27815 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PDE4AP27815 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PDE4AP27815 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PDE4AP27815 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PDE4AP27815 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PDE4AP27815 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PDE4AP27815 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PDE4AP27815 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
PDE4AP27815 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PDE4AP27815 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PDE4AP27815 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PDE4AP27815 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms