Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
HMGB2P26583 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
HMGB2P26583 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
HMGB2P26583 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
HMGB2P26583 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
HMGB2P26583 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
HMGB2P26583 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
HMGB2P26583 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
HMGB2P26583 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
HMGB2P26583 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
HMGB2P26583 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
HMGB2P26583 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
HMGB2P26583 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
HMGB2P26583 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
HMGB2P26583 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
HMGB2P26583 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
HMGB2P26583 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
HMGB2P26583 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
HMGB2P26583 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
HMGB2P26583 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
HMGB2P26583 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
HMGB2P26583 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
HMGB2P26583 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
HMGB2P26583 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
HMGB2P26583 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
HMGB2P26583 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
HMGB2P26583 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
HMGB2P26583 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
HMGB2P26583 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
HMGB2P26583 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
HMGB2P26583 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
HMGB2P26583 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
HMGB2P26583 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
HMGB2P26583 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
HMGB2P26583 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
HMGB2P26583 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
HMGB2P26583 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
HMGB2P26583 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
HMGB2P26583 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
HMGB2P26583 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
HMGB2P26583 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
HMGB2P26583 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
HMGB2P26583 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
HMGB2P26583 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
HMGB2P26583 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
HMGB2P26583 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
HMGB2P26583 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
HMGB2P26583 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
HMGB2P26583 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
HMGB2P26583 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
HMGB2P26583 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
HMGB2P26583 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
HMGB2P26583 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
HMGB2P26583 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
HMGB2P26583 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
HMGB2P26583 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
HMGB2P26583 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
HMGB2P26583 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
HMGB2P26583 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
HMGB2P26583 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
HMGB2P26583 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
HMGB2P26583 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
HMGB2P26583 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
HMGB2P26583 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
HMGB2P26583 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
HMGB2P26583 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
HMGB2P26583 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
HMGB2P26583 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
HMGB2P26583 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
HMGB2P26583 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
HMGB2P26583 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
HMGB2P26583 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
HMGB2P26583 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
HMGB2P26583 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
HMGB2P26583 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
HMGB2P26583 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
HMGB2P26583 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
HMGB2P26583 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
HMGB2P26583 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
HMGB2P26583 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
HMGB2P26583 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
HMGB2P26583 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
HMGB2P26583 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
HMGB2P26583 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.82■■■■□ 3
HMGB2P26583 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.81■■■■□ 3
HMGB2P26583 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
HMGB2P26583 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC33.79■■■■□ 3
HMGB2P26583 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
HMGB2P26583 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
HMGB2P26583 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
HMGB2P26583 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.78■■■■□ 3
HMGB2P26583 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
HMGB2P26583 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
HMGB2P26583 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
HMGB2P26583 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
HMGB2P26583 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
HMGB2P26583 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
HMGB2P26583 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
HMGB2P26583 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
HMGB2P26583 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms