Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMA3P25788 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMA3P25788 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMA3P25788 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMA3P25788 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMA3P25788 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMA3P25788 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMA3P25788 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMA3P25788 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMA3P25788 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMA3P25788 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMA3P25788 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMA3P25788 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMA3P25788 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMA3P25788 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMA3P25788 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMA3P25788 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMA3P25788 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMA3P25788 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMA3P25788 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMA3P25788 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMA3P25788 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMA3P25788 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMA3P25788 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMA3P25788 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMA3P25788 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMA3P25788 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMA3P25788 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMA3P25788 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMA3P25788 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMA3P25788 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PSMA3P25788 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSMA3P25788 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMA3P25788 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMA3P25788 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMA3P25788 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMA3P25788 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMA3P25788 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMA3P25788 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSMA3P25788 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSMA3P25788 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMA3P25788 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMA3P25788 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMA3P25788 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMA3P25788 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMA3P25788 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMA3P25788 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMA3P25788 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMA3P25788 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMA3P25788 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMA3P25788 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMA3P25788 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSMA3P25788 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSMA3P25788 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PSMA3P25788 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMA3P25788 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMA3P25788 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMA3P25788 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMA3P25788 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMA3P25788 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMA3P25788 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMA3P25788 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMA3P25788 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMA3P25788 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMA3P25788 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMA3P25788 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMA3P25788 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMA3P25788 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMA3P25788 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMA3P25788 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMA3P25788 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMA3P25788 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMA3P25788 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMA3P25788 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMA3P25788 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMA3P25788 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMA3P25788 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMA3P25788 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMA3P25788 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMA3P25788 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMA3P25788 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMA3P25788 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMA3P25788 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMA3P25788 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMA3P25788 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMA3P25788 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMA3P25788 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMA3P25788 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMA3P25788 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMA3P25788 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMA3P25788 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMA3P25788 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMA3P25788 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMA3P25788 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMA3P25788 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMA3P25788 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMA3P25788 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PSMA3P25788 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMA3P25788 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMA3P25788 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms