Protein–RNA interactions for Protein: P25367

RNQ1, [PIN+] prion protein RNQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RNQ1P25367 OSH7YHR001W 1314 nt8.47□□□□□ -1.05
RNQ1P25367 SOL2YCR073W-A 948 nt8.46□□□□□ -1.06
RNQ1P25367 SPP2YOR148C 558 nt8.44□□□□□ -1.06
RNQ1P25367 TAT2YOL020W 1779 nt8.43□□□□□ -1.06
RNQ1P25367 IMO32YGR031W 1029 nt8.43□□□□□ -1.06
RNQ1P25367 YDR455CYDR455C 309 nt8.42□□□□□ -1.06
RNQ1P25367 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt8.42□□□□□ -1.06
RNQ1P25367 YJR114WYJR114W 393 nt8.41□□□□□ -1.06
RNQ1P25367 YCR099CYCR099C 468 nt8.4□□□□□ -1.06
RNQ1P25367 IGD1YFR017C 588 nt8.39□□□□□ -1.07
RNQ1P25367 SPS100YHR139C 981 nt8.39□□□□□ -1.07
RNQ1P25367 ACH1YBL015W 1581 nt8.39□□□□□ -1.07
RNQ1P25367 CWC15YDR163W 528 nt8.38□□□□□ -1.07
RNQ1P25367 PET20YPL159C 762 nt8.37□□□□□ -1.07
RNQ1P25367 TOM20YGR082W 552 nt8.36□□□□□ -1.07
RNQ1P25367 CDD1YLR245C 429 nt8.36□□□□□ -1.07
RNQ1P25367 YOR325WYOR325W 474 nt8.36□□□□□ -1.07
RNQ1P25367 AI3Q0060 1248 nt8.35□□□□□ -1.07
RNQ1P25367 NAS2YIL007C 663 nt8.35□□□□□ -1.07
RNQ1P25367 ERG6YML008C 1152 nt8.35□□□□□ -1.07
RNQ1P25367 RIB1YBL033C 1038 nt8.35□□□□□ -1.07
RNQ1P25367 UTP6YDR449C 1323 nt8.33□□□□□ -1.08
RNQ1P25367 HOL1YNR055C 1761 nt8.33□□□□□ -1.08
RNQ1P25367 Q0142Q0142 177 nt8.33□□□□□ -1.08
RNQ1P25367 ILV3YJR016C 1758 nt8.33□□□□□ -1.08
RNQ1P25367 ERG13YML126C 1476 nt8.32□□□□□ -1.08
RNQ1P25367 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt8.32□□□□□ -1.08
RNQ1P25367 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt8.32□□□□□ -1.08
RNQ1P25367 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt8.32□□□□□ -1.08
RNQ1P25367 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt8.32□□□□□ -1.08
RNQ1P25367 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt8.32□□□□□ -1.08
RNQ1P25367 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt8.32□□□□□ -1.08
RNQ1P25367 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt8.32□□□□□ -1.08
RNQ1P25367 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt8.32□□□□□ -1.08
RNQ1P25367 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt8.32□□□□□ -1.08
RNQ1P25367 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt8.32□□□□□ -1.08
RNQ1P25367 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt8.32□□□□□ -1.08
RNQ1P25367 ADE8YDR408C 645 nt8.32□□□□□ -1.08
RNQ1P25367 SOD2YHR008C 702 nt8.32□□□□□ -1.08
RNQ1P25367 YIA6YIL006W 1122 nt8.31□□□□□ -1.08
RNQ1P25367 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.31□□□□□ -1.08
RNQ1P25367 ASP3-1YLR155C 1089 nt8.31□□□□□ -1.08
RNQ1P25367 ASP3-2YLR157C 1089 nt8.31□□□□□ -1.08
RNQ1P25367 ASP3-3YLR158C 1089 nt8.31□□□□□ -1.08
RNQ1P25367 ASP3-4YLR160C 1089 nt8.31□□□□□ -1.08
RNQ1P25367 RRT8YOL048C 1029 nt8.31□□□□□ -1.08
RNQ1P25367 MUP1YGR055W 1725 nt8.31□□□□□ -1.08
RNQ1P25367 IPL1YPL209C 1104 nt8.3□□□□□ -1.08
RNQ1P25367 SAM50YNL026W 1455 nt8.3□□□□□ -1.08
RNQ1P25367 KRE1YNL322C 942 nt8.29□□□□□ -1.08
RNQ1P25367 VPS62YGR141W 1404 nt8.29□□□□□ -1.08
RNQ1P25367 YCP4YCR004C 744 nt8.28□□□□□ -1.08
RNQ1P25367 YCR025CYCR025C 411 nt8.28□□□□□ -1.08
RNQ1P25367 LCP5YER127W 1074 nt8.28□□□□□ -1.08
RNQ1P25367 TVP23YDR084C 600 nt8.27□□□□□ -1.09
RNQ1P25367 AI5_BETAQ0075 1065 nt8.27□□□□□ -1.09
RNQ1P25367 SPE2YOL052C 1191 nt8.27□□□□□ -1.09
RNQ1P25367 snR78snR78 87 nt8.25□□□□□ -1.09
RNQ1P25367 OPI3YJR073C 621 nt8.25□□□□□ -1.09
RNQ1P25367 OPI10YOL032W 741 nt8.25□□□□□ -1.09
RNQ1P25367 ACO2YJL200C 2370 nt8.25□□□□□ -1.09
RNQ1P25367 THP3YPR045C 1413 nt8.23□□□□□ -1.09
RNQ1P25367 LYS20YDL182W 1287 nt8.23□□□□□ -1.09
RNQ1P25367 URH1YDR400W 1023 nt8.23□□□□□ -1.09
RNQ1P25367 SKG1YKR100C 1068 nt8.23□□□□□ -1.09
RNQ1P25367 CCT2YIL142W 1584 nt8.22□□□□□ -1.09
RNQ1P25367 YDL086WYDL086W 822 nt8.22□□□□□ -1.09
RNQ1P25367 FLX1YIL134W 936 nt8.22□□□□□ -1.09
RNQ1P25367 AIM1YAL046C 357 nt8.22□□□□□ -1.09
RNQ1P25367 PHB2YGR231C 933 nt8.21□□□□□ -1.1
RNQ1P25367 ADH3YMR083W 1128 nt8.21□□□□□ -1.1
RNQ1P25367 LSB6YJL100W 1824 nt8.21□□□□□ -1.1
RNQ1P25367 SAC7YDR389W 1965 nt8.21□□□□□ -1.1
RNQ1P25367 SWM1YDR260C 513 nt8.2□□□□□ -1.1
RNQ1P25367 ARO8YGL202W 1503 nt8.19□□□□□ -1.1
RNQ1P25367 RIM8YGL045W 1629 nt8.19□□□□□ -1.1
RNQ1P25367 TPC1YGR096W 945 nt8.19□□□□□ -1.1
RNQ1P25367 YNR068CYNR068C 819 nt8.19□□□□□ -1.1
RNQ1P25367 HMT1YBR034C 1047 nt8.18□□□□□ -1.1
RNQ1P25367 ENO2YHR174W 1314 nt8.18□□□□□ -1.1
RNQ1P25367 COQ8YGL119W 1506 nt8.18□□□□□ -1.1
RNQ1P25367 YER152W-AYER152W-A 567 nt8.17□□□□□ -1.1
RNQ1P25367 POP2YNR052C 1302 nt8.17□□□□□ -1.1
RNQ1P25367 YGL114WYGL114W 2178 nt8.17□□□□□ -1.1
RNQ1P25367 MOB1YIL106W 945 nt8.15□□□□□ -1.1
RNQ1P25367 YPL071CYPL071C 471 nt8.15□□□□□ -1.1
RNQ1P25367 Q0017Q0017 162 nt8.15□□□□□ -1.1
RNQ1P25367 AMF1YOR378W 1548 nt8.14□□□□□ -1.11
RNQ1P25367 FSH2YMR222C 672 nt8.14□□□□□ -1.11
RNQ1P25367 UGP1YKL035W 1500 nt8.13□□□□□ -1.11
RNQ1P25367 Q0255Q0255 1419 nt8.13□□□□□ -1.11
RNQ1P25367 KES1YPL145C 1305 nt8.13□□□□□ -1.11
RNQ1P25367 BET2YPR176C 978 nt8.13□□□□□ -1.11
RNQ1P25367 SER2YGR208W 930 nt8.12□□□□□ -1.11
RNQ1P25367 PCP1YGR101W 1041 nt8.11□□□□□ -1.11
RNQ1P25367 YKR012CYKR012C 378 nt8.11□□□□□ -1.11
RNQ1P25367 YNR064CYNR064C 873 nt8.11□□□□□ -1.11
RNQ1P25367 SGA1YIL099W 1650 nt8.11□□□□□ -1.11
RNQ1P25367 ZAP1YJL056C 2643 nt8.11□□□□□ -1.11
RNQ1P25367 CYC3YAL039C 810 nt8.09□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.9 ms