Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FGFR4P22455 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FGFR4P22455 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FGFR4P22455 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FGFR4P22455 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FGFR4P22455 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FGFR4P22455 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FGFR4P22455 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FGFR4P22455 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FGFR4P22455 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FGFR4P22455 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FGFR4P22455 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FGFR4P22455 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FGFR4P22455 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FGFR4P22455 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FGFR4P22455 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FGFR4P22455 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FGFR4P22455 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FGFR4P22455 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FGFR4P22455 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FGFR4P22455 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
FGFR4P22455 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FGFR4P22455 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FGFR4P22455 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FGFR4P22455 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FGFR4P22455 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FGFR4P22455 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FGFR4P22455 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FGFR4P22455 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
FGFR4P22455 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FGFR4P22455 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FGFR4P22455 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FGFR4P22455 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FGFR4P22455 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FGFR4P22455 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FGFR4P22455 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FGFR4P22455 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FGFR4P22455 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FGFR4P22455 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FGFR4P22455 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FGFR4P22455 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FGFR4P22455 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FGFR4P22455 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FGFR4P22455 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FGFR4P22455 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FGFR4P22455 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FGFR4P22455 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FGFR4P22455 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FGFR4P22455 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FGFR4P22455 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FGFR4P22455 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FGFR4P22455 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FGFR4P22455 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FGFR4P22455 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FGFR4P22455 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FGFR4P22455 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FGFR4P22455 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FGFR4P22455 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FGFR4P22455 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FGFR4P22455 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FGFR4P22455 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FGFR4P22455 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FGFR4P22455 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FGFR4P22455 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FGFR4P22455 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FGFR4P22455 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FGFR4P22455 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FGFR4P22455 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
FGFR4P22455 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FGFR4P22455 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
FGFR4P22455 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
FGFR4P22455 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
FGFR4P22455 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FGFR4P22455 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
FGFR4P22455 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FGFR4P22455 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FGFR4P22455 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FGFR4P22455 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FGFR4P22455 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FGFR4P22455 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
FGFR4P22455 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FGFR4P22455 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FGFR4P22455 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FGFR4P22455 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
FGFR4P22455 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
FGFR4P22455 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FGFR4P22455 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FGFR4P22455 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FGFR4P22455 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FGFR4P22455 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FGFR4P22455 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FGFR4P22455 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FGFR4P22455 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FGFR4P22455 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
FGFR4P22455 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FGFR4P22455 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FGFR4P22455 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FGFR4P22455 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FGFR4P22455 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FGFR4P22455 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms