Protein–RNA interactions for Protein: P21580

TNFAIP3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP3P21580 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNFAIP3P21580 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNFAIP3P21580 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNFAIP3P21580 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNFAIP3P21580 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNFAIP3P21580 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNFAIP3P21580 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNFAIP3P21580 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNFAIP3P21580 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNFAIP3P21580 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TNFAIP3P21580 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNFAIP3P21580 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNFAIP3P21580 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNFAIP3P21580 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNFAIP3P21580 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNFAIP3P21580 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNFAIP3P21580 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNFAIP3P21580 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNFAIP3P21580 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNFAIP3P21580 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNFAIP3P21580 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNFAIP3P21580 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNFAIP3P21580 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNFAIP3P21580 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNFAIP3P21580 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNFAIP3P21580 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNFAIP3P21580 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNFAIP3P21580 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNFAIP3P21580 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNFAIP3P21580 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNFAIP3P21580 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNFAIP3P21580 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNFAIP3P21580 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNFAIP3P21580 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNFAIP3P21580 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNFAIP3P21580 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNFAIP3P21580 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNFAIP3P21580 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNFAIP3P21580 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFAIP3P21580 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFAIP3P21580 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFAIP3P21580 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFAIP3P21580 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNFAIP3P21580 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNFAIP3P21580 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNFAIP3P21580 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNFAIP3P21580 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNFAIP3P21580 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNFAIP3P21580 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNFAIP3P21580 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNFAIP3P21580 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNFAIP3P21580 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNFAIP3P21580 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNFAIP3P21580 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNFAIP3P21580 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNFAIP3P21580 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNFAIP3P21580 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNFAIP3P21580 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNFAIP3P21580 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNFAIP3P21580 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNFAIP3P21580 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNFAIP3P21580 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TNFAIP3P21580 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TNFAIP3P21580 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNFAIP3P21580 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNFAIP3P21580 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNFAIP3P21580 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNFAIP3P21580 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNFAIP3P21580 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNFAIP3P21580 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNFAIP3P21580 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNFAIP3P21580 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNFAIP3P21580 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNFAIP3P21580 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNFAIP3P21580 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNFAIP3P21580 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNFAIP3P21580 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TNFAIP3P21580 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNFAIP3P21580 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms