Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AMD1P17707 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AMD1P17707 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AMD1P17707 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AMD1P17707 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AMD1P17707 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AMD1P17707 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AMD1P17707 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AMD1P17707 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AMD1P17707 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
AMD1P17707 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AMD1P17707 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AMD1P17707 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AMD1P17707 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AMD1P17707 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AMD1P17707 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AMD1P17707 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AMD1P17707 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMD1P17707 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMD1P17707 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMD1P17707 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AMD1P17707 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
AMD1P17707 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
AMD1P17707 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AMD1P17707 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
AMD1P17707 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AMD1P17707 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AMD1P17707 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AMD1P17707 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AMD1P17707 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AMD1P17707 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AMD1P17707 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
AMD1P17707 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AMD1P17707 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AMD1P17707 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AMD1P17707 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AMD1P17707 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AMD1P17707 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AMD1P17707 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AMD1P17707 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AMD1P17707 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AMD1P17707 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
AMD1P17707 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AMD1P17707 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AMD1P17707 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AMD1P17707 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AMD1P17707 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AMD1P17707 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AMD1P17707 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
AMD1P17707 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AMD1P17707 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AMD1P17707 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AMD1P17707 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AMD1P17707 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AMD1P17707 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AMD1P17707 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AMD1P17707 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AMD1P17707 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AMD1P17707 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AMD1P17707 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AMD1P17707 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AMD1P17707 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AMD1P17707 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AMD1P17707 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AMD1P17707 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AMD1P17707 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AMD1P17707 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
AMD1P17707 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AMD1P17707 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
AMD1P17707 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AMD1P17707 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AMD1P17707 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
AMD1P17707 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AMD1P17707 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AMD1P17707 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AMD1P17707 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AMD1P17707 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AMD1P17707 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AMD1P17707 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AMD1P17707 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AMD1P17707 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AMD1P17707 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AMD1P17707 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
AMD1P17707 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AMD1P17707 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AMD1P17707 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AMD1P17707 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AMD1P17707 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AMD1P17707 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AMD1P17707 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AMD1P17707 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AMD1P17707 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AMD1P17707 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AMD1P17707 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AMD1P17707 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AMD1P17707 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AMD1P17707 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AMD1P17707 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AMD1P17707 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AMD1P17707 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms