Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VAV1P15498 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VAV1P15498 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VAV1P15498 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VAV1P15498 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VAV1P15498 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VAV1P15498 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VAV1P15498 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VAV1P15498 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VAV1P15498 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VAV1P15498 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VAV1P15498 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VAV1P15498 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VAV1P15498 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VAV1P15498 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VAV1P15498 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
VAV1P15498 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VAV1P15498 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VAV1P15498 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VAV1P15498 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VAV1P15498 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VAV1P15498 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VAV1P15498 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VAV1P15498 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VAV1P15498 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VAV1P15498 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VAV1P15498 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VAV1P15498 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VAV1P15498 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
VAV1P15498 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VAV1P15498 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VAV1P15498 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VAV1P15498 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VAV1P15498 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VAV1P15498 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VAV1P15498 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VAV1P15498 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VAV1P15498 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VAV1P15498 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VAV1P15498 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VAV1P15498 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VAV1P15498 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VAV1P15498 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VAV1P15498 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VAV1P15498 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VAV1P15498 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VAV1P15498 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VAV1P15498 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
VAV1P15498 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VAV1P15498 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VAV1P15498 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VAV1P15498 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VAV1P15498 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
VAV1P15498 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VAV1P15498 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VAV1P15498 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VAV1P15498 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VAV1P15498 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VAV1P15498 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VAV1P15498 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VAV1P15498 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VAV1P15498 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VAV1P15498 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VAV1P15498 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VAV1P15498 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VAV1P15498 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VAV1P15498 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VAV1P15498 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VAV1P15498 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VAV1P15498 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VAV1P15498 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VAV1P15498 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VAV1P15498 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VAV1P15498 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VAV1P15498 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
VAV1P15498 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
VAV1P15498 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VAV1P15498 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VAV1P15498 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
VAV1P15498 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
VAV1P15498 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
VAV1P15498 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
VAV1P15498 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
VAV1P15498 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VAV1P15498 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VAV1P15498 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VAV1P15498 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VAV1P15498 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VAV1P15498 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VAV1P15498 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VAV1P15498 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
VAV1P15498 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VAV1P15498 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VAV1P15498 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
VAV1P15498 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VAV1P15498 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VAV1P15498 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VAV1P15498 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VAV1P15498 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VAV1P15498 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms