Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRA1P14867 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRA1P14867 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRA1P14867 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GABRA1P14867 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GABRA1P14867 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GABRA1P14867 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABRA1P14867 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABRA1P14867 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABRA1P14867 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABRA1P14867 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABRA1P14867 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABRA1P14867 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GABRA1P14867 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABRA1P14867 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABRA1P14867 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABRA1P14867 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABRA1P14867 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABRA1P14867 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GABRA1P14867 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABRA1P14867 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABRA1P14867 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABRA1P14867 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GABRA1P14867 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABRA1P14867 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABRA1P14867 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABRA1P14867 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABRA1P14867 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABRA1P14867 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABRA1P14867 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABRA1P14867 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABRA1P14867 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABRA1P14867 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABRA1P14867 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRA1P14867 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRA1P14867 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABRA1P14867 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABRA1P14867 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABRA1P14867 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABRA1P14867 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABRA1P14867 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABRA1P14867 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABRA1P14867 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABRA1P14867 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABRA1P14867 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABRA1P14867 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABRA1P14867 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABRA1P14867 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABRA1P14867 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABRA1P14867 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRA1P14867 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRA1P14867 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRA1P14867 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRA1P14867 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRA1P14867 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRA1P14867 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRA1P14867 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRA1P14867 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRA1P14867 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRA1P14867 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRA1P14867 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRA1P14867 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRA1P14867 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRA1P14867 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABRA1P14867 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABRA1P14867 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABRA1P14867 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABRA1P14867 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRA1P14867 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRA1P14867 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRA1P14867 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRA1P14867 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRA1P14867 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRA1P14867 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRA1P14867 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRA1P14867 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRA1P14867 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRA1P14867 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRA1P14867 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRA1P14867 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRA1P14867 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRA1P14867 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRA1P14867 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRA1P14867 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRA1P14867 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRA1P14867 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRA1P14867 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRA1P14867 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRA1P14867 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRA1P14867 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRA1P14867 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRA1P14867 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GABRA1P14867 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRA1P14867 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRA1P14867 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRA1P14867 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRA1P14867 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRA1P14867 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRA1P14867 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRA1P14867 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms