Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GP1BBP13224 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GP1BBP13224 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GP1BBP13224 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GP1BBP13224 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GP1BBP13224 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GP1BBP13224 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GP1BBP13224 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GP1BBP13224 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GP1BBP13224 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GP1BBP13224 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GP1BBP13224 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GP1BBP13224 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GP1BBP13224 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GP1BBP13224 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GP1BBP13224 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GP1BBP13224 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GP1BBP13224 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GP1BBP13224 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GP1BBP13224 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GP1BBP13224 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GP1BBP13224 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GP1BBP13224 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GP1BBP13224 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GP1BBP13224 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GP1BBP13224 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GP1BBP13224 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GP1BBP13224 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GP1BBP13224 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GP1BBP13224 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GP1BBP13224 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GP1BBP13224 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GP1BBP13224 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GP1BBP13224 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GP1BBP13224 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GP1BBP13224 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GP1BBP13224 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GP1BBP13224 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GP1BBP13224 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GP1BBP13224 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GP1BBP13224 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GP1BBP13224 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GP1BBP13224 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GP1BBP13224 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GP1BBP13224 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GP1BBP13224 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GP1BBP13224 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GP1BBP13224 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GP1BBP13224 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GP1BBP13224 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GP1BBP13224 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GP1BBP13224 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GP1BBP13224 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GP1BBP13224 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GP1BBP13224 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GP1BBP13224 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GP1BBP13224 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GP1BBP13224 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GP1BBP13224 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GP1BBP13224 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GP1BBP13224 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GP1BBP13224 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GP1BBP13224 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GP1BBP13224 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GP1BBP13224 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GP1BBP13224 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GP1BBP13224 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GP1BBP13224 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GP1BBP13224 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GP1BBP13224 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GP1BBP13224 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GP1BBP13224 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GP1BBP13224 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GP1BBP13224 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GP1BBP13224 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GP1BBP13224 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GP1BBP13224 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GP1BBP13224 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GP1BBP13224 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GP1BBP13224 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GP1BBP13224 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GP1BBP13224 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GP1BBP13224 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GP1BBP13224 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GP1BBP13224 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GP1BBP13224 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GP1BBP13224 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GP1BBP13224 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GP1BBP13224 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GP1BBP13224 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GP1BBP13224 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GP1BBP13224 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GP1BBP13224 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GP1BBP13224 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GP1BBP13224 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GP1BBP13224 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GP1BBP13224 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GP1BBP13224 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GP1BBP13224 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GP1BBP13224 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms