Protein–RNA interactions for Protein: P0CAP2

POLR2M, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2MP0CAP2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
POLR2MP0CAP2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
POLR2MP0CAP2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
POLR2MP0CAP2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
POLR2MP0CAP2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
POLR2MP0CAP2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
POLR2MP0CAP2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
POLR2MP0CAP2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
POLR2MP0CAP2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
POLR2MP0CAP2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
POLR2MP0CAP2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
POLR2MP0CAP2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
POLR2MP0CAP2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
POLR2MP0CAP2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
POLR2MP0CAP2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
POLR2MP0CAP2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
POLR2MP0CAP2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.41
POLR2MP0CAP2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
POLR2MP0CAP2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
POLR2MP0CAP2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
POLR2MP0CAP2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
POLR2MP0CAP2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
POLR2MP0CAP2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
POLR2MP0CAP2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
POLR2MP0CAP2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
POLR2MP0CAP2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLR2MP0CAP2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLR2MP0CAP2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLR2MP0CAP2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
POLR2MP0CAP2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
POLR2MP0CAP2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
POLR2MP0CAP2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
POLR2MP0CAP2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
POLR2MP0CAP2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
POLR2MP0CAP2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
POLR2MP0CAP2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
POLR2MP0CAP2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
POLR2MP0CAP2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
POLR2MP0CAP2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
POLR2MP0CAP2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
POLR2MP0CAP2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLR2MP0CAP2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
POLR2MP0CAP2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
POLR2MP0CAP2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
POLR2MP0CAP2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
POLR2MP0CAP2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
POLR2MP0CAP2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
POLR2MP0CAP2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
POLR2MP0CAP2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
POLR2MP0CAP2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
POLR2MP0CAP2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
POLR2MP0CAP2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
POLR2MP0CAP2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
POLR2MP0CAP2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLR2MP0CAP2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
POLR2MP0CAP2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLR2MP0CAP2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLR2MP0CAP2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLR2MP0CAP2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLR2MP0CAP2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLR2MP0CAP2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLR2MP0CAP2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLR2MP0CAP2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLR2MP0CAP2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
POLR2MP0CAP2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
POLR2MP0CAP2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
POLR2MP0CAP2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
POLR2MP0CAP2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
POLR2MP0CAP2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
POLR2MP0CAP2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLR2MP0CAP2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLR2MP0CAP2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLR2MP0CAP2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLR2MP0CAP2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLR2MP0CAP2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
POLR2MP0CAP2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLR2MP0CAP2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLR2MP0CAP2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLR2MP0CAP2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
POLR2MP0CAP2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
POLR2MP0CAP2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
POLR2MP0CAP2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
POLR2MP0CAP2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
POLR2MP0CAP2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
POLR2MP0CAP2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
POLR2MP0CAP2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
POLR2MP0CAP2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
POLR2MP0CAP2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
POLR2MP0CAP2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
POLR2MP0CAP2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
POLR2MP0CAP2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
POLR2MP0CAP2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
POLR2MP0CAP2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
POLR2MP0CAP2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLR2MP0CAP2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLR2MP0CAP2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLR2MP0CAP2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLR2MP0CAP2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
POLR2MP0CAP2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
POLR2MP0CAP2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms