Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC175P0C221 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC175P0C221 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC175P0C221 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC175P0C221 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC175P0C221 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC175P0C221 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC175P0C221 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC175P0C221 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC175P0C221 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC175P0C221 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC175P0C221 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC175P0C221 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC175P0C221 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC175P0C221 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC175P0C221 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC175P0C221 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC175P0C221 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC175P0C221 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC175P0C221 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC175P0C221 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC175P0C221 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC175P0C221 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC175P0C221 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC175P0C221 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC175P0C221 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC175P0C221 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC175P0C221 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC175P0C221 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC175P0C221 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC175P0C221 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC175P0C221 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC175P0C221 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC175P0C221 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC175P0C221 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC175P0C221 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC175P0C221 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC175P0C221 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC175P0C221 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC175P0C221 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC175P0C221 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC175P0C221 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC175P0C221 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC175P0C221 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC175P0C221 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC175P0C221 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC175P0C221 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC175P0C221 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC175P0C221 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC175P0C221 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC175P0C221 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC175P0C221 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC175P0C221 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC175P0C221 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC175P0C221 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC175P0C221 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC175P0C221 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC175P0C221 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC175P0C221 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC175P0C221 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC175P0C221 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC175P0C221 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC175P0C221 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC175P0C221 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC175P0C221 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC175P0C221 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC175P0C221 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC175P0C221 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC175P0C221 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC175P0C221 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC175P0C221 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC175P0C221 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC175P0C221 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC175P0C221 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC175P0C221 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC175P0C221 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC175P0C221 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC175P0C221 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC175P0C221 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC175P0C221 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC175P0C221 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC175P0C221 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC175P0C221 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC175P0C221 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC175P0C221 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC175P0C221 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC175P0C221 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC175P0C221 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC175P0C221 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC175P0C221 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC175P0C221 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC175P0C221 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC175P0C221 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC175P0C221 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC175P0C221 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC175P0C221 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC175P0C221 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC175P0C221 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC175P0C221 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC175P0C221 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms