Protein–RNA interactions for Protein: P09603

CSF1, Macrophage colony-stimulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1P09603 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF1P09603 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF1P09603 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF1P09603 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF1P09603 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF1P09603 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF1P09603 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF1P09603 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF1P09603 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF1P09603 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF1P09603 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF1P09603 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF1P09603 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF1P09603 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF1P09603 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF1P09603 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF1P09603 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF1P09603 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF1P09603 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF1P09603 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF1P09603 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF1P09603 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF1P09603 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF1P09603 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF1P09603 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF1P09603 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF1P09603 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF1P09603 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF1P09603 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF1P09603 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF1P09603 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF1P09603 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF1P09603 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF1P09603 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF1P09603 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF1P09603 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF1P09603 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF1P09603 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF1P09603 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF1P09603 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF1P09603 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF1P09603 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF1P09603 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF1P09603 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF1P09603 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF1P09603 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF1P09603 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF1P09603 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF1P09603 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF1P09603 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF1P09603 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF1P09603 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF1P09603 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSF1P09603 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF1P09603 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF1P09603 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF1P09603 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF1P09603 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF1P09603 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF1P09603 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF1P09603 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF1P09603 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF1P09603 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF1P09603 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF1P09603 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF1P09603 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF1P09603 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF1P09603 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF1P09603 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF1P09603 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF1P09603 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF1P09603 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF1P09603 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF1P09603 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF1P09603 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF1P09603 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF1P09603 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF1P09603 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF1P09603 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSF1P09603 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF1P09603 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF1P09603 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF1P09603 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF1P09603 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF1P09603 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF1P09603 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF1P09603 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF1P09603 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF1P09603 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF1P09603 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF1P09603 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF1P09603 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF1P09603 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF1P09603 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF1P09603 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF1P09603 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF1P09603 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF1P09603 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF1P09603 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF1P09603 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms